chk文件批量转化为fchk时遇到的问题及解决方法

PESPES

批处理脚本：
#!/bin/bash
for inf in *.chk
do
formchk ${inf}
done


遇到的问题：


1.’syntax error near unexpected token do’


2.Segmentation fault




解决方法:


1.这种情况发生的原因是因为处理文件的换行符是dos格式的"\r\n" 可以使用cat  -v 文件名来查看换行符属于哪种种格式。如果是前者，则行结尾会是^M，需要转换成linux/unix格式的"\n"。转换命令sed  's/\r//' 原文件 > 转换后文件。


2.内存不足，需要给与更大的内存，命令export GAUSS_MEMDEF=200000000，单位是比特。