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[分子对接] 分子对接后用Pymol可视化和同一文件用moe可视化显示出的氢键为什么不一样?

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如下图,我是选择了to any atoms出现可能产生的氢键比在moe中出现的氢键多,这是为什么?
还有想请问大佬们,pymol可视化对接结果显示氢键选择哪个是to any atoms还是to other atoms in object还是其他两个选项呢?这四个选项有什么区别呀?
顺便问一下pymol可视化对接结果如何显示小分子在蛋白的口袋surface?

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pymol可视化氢键选择

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moe可视化

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pymol可视化

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发表于 Post on 2021-8-8 09:40:38 | 只看该作者 Only view this author
我看有说选择的是TO any atoms这个选项

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喵星人

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发表于 Post on 2021-8-8 04:58:06 | 只看该作者 Only view this author
判定标准不一样(角度,长度),而且都不算合理

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