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[综合交流] 计算两个选区间最近的两个原子间距离并给出原子号

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本帖最后由 dai123 于 2021-6-3 15:43 编辑

想要计算蛋白质上某一残基与石墨烯平面间的最近原子距离,看到sobereva老师有发下面的命令,想知道这个命令的各个步骤的意思及具体用法

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-4 09:15:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-4 06:03
在北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里对tcl语法 ...

谢谢sobereva老师

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发表于 Post on 2021-6-4 06:03:12 | 只看该作者 Only view this author
在北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里对tcl语法和VMD内置的命令系统地讲解,学过自然就会了,几句话没法给你解释清楚脚本里每一行。只能是你对某两三行有疑问的话我给你解释。

自学的话,看http://bbs.keinsci.com/thread-157-1-1.html先了解tcl基本语法,然后看VMD的user guide里面对VMD内置命令的介绍,里面也有简单的tcl脚本的例子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-3 16:09:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-3 15:59
学术求助帖绝对不得发到公社大厅板块,看清楚板块再发贴。这次给你移动了,下次将删帖+扣分处理

好的

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发表于 Post on 2021-6-3 15:59:42 | 只看该作者 Only view this author
学术求助帖绝对不得发到公社大厅板块,看清楚板块再发贴。这次给你移动了,下次将删帖+扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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