Multiwfn做荷分解分析(CDA)问题求助

lzhu · 发表于 Post on 2021-6-23 09:30:15

sob老师，我学习了您利用Multiwfn做荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图的文章。我自己也尝试做了一下，做完之后发现片段二向片段一转移的净电子有九十多这是什么原因啊，是因为我体系太大还是包含了金属啊。还有这个电荷分解能不能只看反应中心的啊下面是我的初始结构（我分了两个片段，框起来的和其余部分）和分析得到的结果。

lzhu · 发表于 Post on 2021-7-1 10:02:35

谢谢老师，我明白了

sobereva · 发表于 Post on 2021-7-1 06:06:01

lzhu 发表于 2021-6-24 09:23
老师，您说的恰当设置轨道相互作用图的绘制方式是改变相互作用能量图中的上下限吗？我看到博文中的范例的上 ...

绘图设置仔细看博文里靠后部分的ppt
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166

作图的能量范围显然根据实际情况判断什么范围合适，感兴趣的能级才应当纳入到作图的能量范围里

DFT-D色散校正根本不影响波函数，当然也不影响CDA结果

如果想得到我的及时回复，以后记得点击我的回复帖子下面的“回复”按钮

lzhu · 发表于 Post on 2021-6-24 09:23:18

老师，您说的恰当设置轨道相互作用图的绘制方式是改变相互作用能量图中的上下限吗？我看到博文中的范例的上下限是-30，10ev,这个数值是怎么确定的啊？还有我的优化方法是b3lyp-d3,不知道色散矫正对CDA有没有影响，计算CDA的时候需不需要在命令行去掉？麻烦老师了！

sobereva · 发表于 Post on 2021-6-24 01:10:19

lzhu 发表于 2021-6-23 17:47
老师，我分析的是碳碳双键插入Pd-C键的过程，在画轨道的相互作用图的时候可不可以只显示反应中心原子参与 ...

你的文件明显有问题，整体和片段的坐标根本不对应，明显是忘了用nosymm。用目前官网上最新的Multiwfn都没法通过CDA功能的坐标检查

恰当设置轨道相互作用图的绘制方式，就可以避免把没有参与混合轨道的横杠显示出来，但没法以中心原子参与程度作为是否显示的判据。

lzhu · 发表于 Post on 2021-6-23 17:47:58

本帖最后由 lzhu 于 2021-6-23 19:28 编辑

sobereva 发表于 2021-6-23 16:54
可能输入文件有问题。需要提供你的输入文件。压缩后如果小于5兆直接上传，如果大于5兆传网盘

显然能用于 ...

老师，我分析的是碳碳双键插入Pd-C键的过程，在画轨道的相互作用图的时候可不可以只显示反应中心原子参与的轨道。对于其他的轨道不显示。输入文件在附件中

sobereva · 发表于 Post on 2021-6-23 16:54:30

可能输入文件有问题。需要提供你的输入文件。压缩后如果小于5兆直接上传，如果大于5兆传网盘

显然能用于含过渡金属的情况，过渡金属配合物是CDA用得最多的场合

“只看反应中心”语义不明，不知道你想怎看

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