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[蛋白质建模] RoseTTAFold如何在虚拟机centOS上安装?

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RoseTTAFold如何在虚拟机centOS上安装?

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发表于 Post on 2021-7-20 18:08:36 | 只看该作者 Only view this author
沐雨书生 发表于 2021-7-19 22:56
我是在这一步出现问题的,是不是虚拟机里面没有cuda
Create conda environment using RoseTTAFold-linux ...

VMware虚拟机不支持GPU加速,也没法装nvidia驱动
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-19 22:56:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-19 22:50
虚拟机里的安装方式和实体机完全一样
程序都应当自带了安装方式的说明

我是在这一步出现问题的,是不是虚拟机里面没有cuda
Create conda environment using RoseTTAFold-linux.yml file and folding-linux.yml file. The latter is required to run a pyrosetta version only (run_pyrosetta_ver.sh).
# create conda environment for RoseTTAFold
#   If your NVIDIA driver compatible with cuda11
conda env create -f RoseTTAFold-linux.yml
#   If not (but compatible with cuda10)
conda env create -f RoseTTAFold-linux-cu101.yml

# create conda environment for pyRosetta folding & running DeepAccNet
conda env create -f folding-linux.yml

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发表于 Post on 2021-7-19 22:50:43 | 只看该作者 Only view this author
虚拟机里的安装方式和实体机完全一样
程序都应当自带了安装方式的说明
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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