[GROMACS] 求助：gromacs进行拉伸模拟

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发表于 Post on 2021-9-1 21:04:48 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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现在我想将两个组之间添加一个弹性势进行限制，参考组pulla和拉伸组pullb的质心坐标x，y大致相当，pulla的z要小于pullb。初始时，pulla与pullb相距5.4nm，我想在它们之间添加一个原长为3.2nm的弹簧。mdp文件如下。但是它们之间距离好像并没用明显减小。请问mdp文件是不是错了？

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