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[GROMACS] 用MD构建ZnSO4水溶液盒子+锌金属表面锌金属原子参数怎么设定呢?

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楼主
想做一个关于把一个硫酸锌水溶液盒子放在Zn的(002)晶面上的MD模拟,来看水分子或者溶液中的Zn离子有没有在锌原子表面吸附等特征,溶液方面用的是GAFF力场,但是不知道Zn原子的参数在哪里找。bcc结构的金属Mg、Cu等有人做过,也有比较成熟的参数了,但是一直搜不到Zn原子(六方密堆积,hcp)的参数,想问问各位老师,有做过相关的模拟中锌金属原子的相关参数是从哪里来的?怎么设定的呢?

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发表于 Post on 2025-11-22 05:40:14 | 只看该作者 Only view this author
请问您现在有Zn金属的相关力场吗?如何解决的呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-25 14:45:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-20 08:04
你这个情况建议你用CP2K跑DFT的动力学。除非有类似的文章研究的体系和你的差不多,否则恐怕很难找到靠谱的 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-25 14:44:58 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-11-19 17:12
我估计没有什么力场能描述Zn2+在Zn(s)上的吸附,因为这个吸附的共价性太强了。如果描述的是[Zn(OH2)6]2+在 ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2021-11-20 08:04:41 | 只看该作者 Only view this author
你这个情况建议你用CP2K跑DFT的动力学。除非有类似的文章研究的体系和你的差不多,否则恐怕很难找到靠谱的参数(至少是GROMACS能用的范畴内)

Zn离子可以用Merz的,但是金属Zn的力场而且在GROMACS里能用的应该不存在。而且就算有能在Lammps等支持更多势函数的程序里用的,由于你的研究牵扯到Zn离子吸附到Zn金属表面上的状态变化过程,又没有能用的了。
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发表于 Post on 2021-11-19 17:12:34 | 只看该作者 Only view this author
我估计没有什么力场能描述Zn2+在Zn(s)上的吸附,因为这个吸附的共价性太强了。如果描述的是[Zn(OH2)6]2+在没有任何水分子解离的条件下的吸附,那可能还有戏
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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