求助：如何绘制透明的圆柱形边界管道

PommernCub · 发表于 Post on 2021-11-23 17:22:12

本帖最后由 PommernCub 于 2021-11-23 17:24 编辑

想用vmd绘制一个圆柱形边界，像box那样框线的或者是透明的都行，需要能看到里面加载的分子。我看了参考手册，只会用graphics top cylinder画圆柱，但是圆柱会把里面的分子完全挡住，调了透明度能看到画的轴线，但就是看不到分子，我猜测可能是图层的原因。

有没有大佬可以教教我怎么调图层呢？或者有没有大佬会画圆柱形的box边界呢？不管用什么方法，画成啥样都行，唯一要求是能看到里面的分子，TAT

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-24 08:11:21

此文里我都写了
谈谈分子半径的计算和分子形状的描述
http://sobereva.com/190

PommernCub · 发表于 Post on 2021-11-23 22:32:04

ggdh 发表于 2021-11-23 18:12
graphics 0 material Transparent
graphics 0 cylinder {-7 0 0} {7 0 0} radius 8 resolution 30 filled ...

哇！谢谢你！原来graphics后面就可以指定图层了:)
p.s. 我发现同一个图层还是看不到里面，但是却能看到我画的线；我又导入了一层来画这个圆柱，然后把分子那一层make top这样才看到。
非常感谢！180度鞠躬！

ggdh · 发表于 Post on 2021-11-23 18:12:03

graphics 0 material Transparent
graphics 0 cylinder {-7 0 0} {7 0 0} radius 8 resolution 30 filled no

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