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[新手求助] 请教一下各位老师,同学,关于拉伸一个氢原子来带动一些其它原子的振动能量分析

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楼主
附上可以通过Jmol软件打开的一个文件。再打开文件后,可以通过点击工具-(T)> 震动-(V)...->开始振动(V)来观测拉伸一个氢原子来带动一些其它原子的振动情况。
麻烦各位老师,同学看一看,提供一些建议,谢谢!



massEigenVector.xyz_jmol

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-2 01:03:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-2 00:03
没有这种考察方式
顶多是看把某个氢拉一下(例如和其它某个原子间的距离设得更远)看之后其它原子的坐标怎 ...

谢谢老师的建议!

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发表于 Post on 2022-1-2 00:03:08 | 只看该作者 Only view this author
没有这种考察方式
顶多是看把某个氢拉一下(例如和其它某个原子间的距离设得更远)看之后其它原子的坐标怎么变化(限制性优化),或者拉完后做振动分析看与这个氢无关的振动模式相对于原先怎么发生变化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-1 22:31:28 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-1-1 17:02
你这个帖子都是陈述句,没看懂你要问什么问题

不好意思,我之前没表达清楚。请问通过一个氢原子拉伸来带动其它原子的振动,相关带动原子的能量分析该怎么得到呢或者怎么知道哪些原子的振动是被这一个氢原子带动的呢?

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发表于 Post on 2022-1-1 17:02:26 | 只看该作者 Only view this author
你这个帖子都是陈述句,没看懂你要问什么问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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