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[新手求助] 光催化反应自由能变计算问题请教

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本帖最后由 muyispurs 于 2022-1-2 19:10 编辑

最近老师让算一个光催化反应的自由能变,想从计算的角度辅助说明实验的结果。其中有一步反应如下图,

然后我采用了#p opt freq b3lyp/6-311g(d) scrf=(smd,solvent=ethylethanoate,read) em=gd3进行几何优化和振动分析。
再用#p b3lyp/6-311+g(d,p) scrf=(smd,solvent=ethylethanoate,read) em=gd3进行单点能的计算。结果deltaG=+99kJ/mol,这个能量说明基本不能发生反应,与实验以及其他文献中类似光催化剂的结果不符。
计算文件和计算方法的参考文献见附件 result.zip (7.41 MB, 下载次数 Times of downloads: 27) Wu-2021-Unravelling an oxygen-mediated reducti.pdf (683.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)
有几点想请教的:1)几何优化和振动分析没加弥散函数是因为算力有限,所以在单点能计算时才加弥散进行计算,不知是否会影响结果;2)三线态T1和基态的能量差为188kJ/mol,和光谱测试结果(220kJ/mol)以及类似光催化剂相比都偏小,而胺及其阳离子的自由能差值和上面参考文献中的三乙胺差不多,所以是计算方法不适用该光催化剂体系吗;
3)溶剂的影响会很大吗。实验的溶剂是碳酸二乙酯,Gaussian里没有这个溶剂,所以我用乙酸乙酯的参数来代替,并定义了eps和epsinf,个人感觉影响不会很大;
4)是否有其他我没注意到的错误。
由于也是接触计算化学不久,实在找不到问题所在,所以想来请教一下大家。




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发表于 Post on 2022-1-3 23:31:21 | 只看该作者 Only view this author
muyispurs 发表于 2022-1-3 15:32
这个反应我看所附文献中说是个不可逆反应,因为催化剂不可能从阴离子自由基回到激发态的,但即使如此,+9 ...

哦我才看到你的反应物底下写了个T1,是想说它是处于T1态是吧?那确实(假如不考虑计算误差的话)基本可以认为不反应了,因为激发态分子寿命没那么长。
不过有可能产物阴阳离子并不是完全分离开的,这样会让产物的自由能降低一些
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-3 22:35:12 | 只看该作者 Only view this author
fatpig 发表于 2022-1-3 19:37
所以...你的deltaG是怎么算的呢?
如果直接不算单点,就用优化那一步的deltaG是多少?

感谢回复。deltaG就是用产物的自由能(校正后)-反应物的自由能(校正后)。直接不算单点的我也算过,基本没有差别。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-3 22:32:44 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-1-2 21:18
99kJ/mol还是勉强可以算可以反应的,应该换算成速率常数来判断是否算可以反应,而不要机械性地看数值本身 ...

这个反应我看所附文献中说是个不可逆反应,因为催化剂不可能从阴离子自由基回到激发态的,但即使如此,+99kJ/mol对金属光催化剂而言都已经是个很难发生反应的能量了,而我的有机光催化剂的激发态寿命更短,按理来说就更困难了。换算成速率常数来判断的事我再查一下文献,十分感谢。

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发表于 Post on 2022-1-3 19:37:40 | 只看该作者 Only view this author
所以...你的deltaG是怎么算的呢?
如果直接不算单点,就用优化那一步的deltaG是多少?

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发表于 Post on 2022-1-2 21:18:15 | 只看该作者 Only view this author
muyispurs 发表于 2022-1-2 13:43
感谢回复。您所说的光照应该是光催化剂到激发态的过程,这步不用deltaG来判断我可以理解,但我所计算的反 ...

99kJ/mol还是勉强可以算可以反应的,应该换算成速率常数来判断是否算可以反应,而不要机械性地看数值本身。如果后续反应足够快且热力学足够有利,是有可能拉动这个反应平衡往下走的
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-2 20:43:52 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-1-2 20:26
判断光催化反应能否进行,不能用deltaG,deltaG只适用于等温等压,且没有非机械力做功的系统,而光照属于非 ...

感谢回复。您所说的光照应该是光催化剂到激发态的过程,这步不用deltaG来判断我可以理解,但我所计算的反应是一个单电子转移的反应,即三线态光催化剂氧化胺的过程。我文中所附的文献中也是以deltaG来判断反应的程度的。

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发表于 Post on 2022-1-2 20:26:19 | 只看该作者 Only view this author
判断光催化反应能否进行,不能用deltaG,deltaG只适用于等温等压,且没有非机械力做功的系统,而光照属于非机械力做功。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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