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[配置讨论] 配置一台电脑,主要用于gromacs和comsol模拟,大家给点建议

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本帖最后由 LWF 于 2022-1-6 21:35 编辑

这是我们课题组内拟定的配置,主要用于分子动力学,期望各位老师帮忙给点意见

202201061959572906..png (20.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

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发表于 Post on 2022-1-9 16:12:14 | 只看该作者 Only view this author
不知道你们gmx和comsol一起用是做什么研究,如果comsol用得很频繁,那么双路平台配1块GPU也无妨,内存还是用12*16GB
只是需要注意绑定CPU
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发表于 Post on 2022-1-9 15:57:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-1-9 16:01 编辑
LWF 发表于 2022-1-9 15:33
那就是在现有的基础上加至12根内存条和两块3070的显卡,这有点我们的预算了。10根内存条可以加,但是这个 ...

12根16GB 2666和10根16GB 2666就差800元。12根8GB都够了。TB上买寨条/二手条还能便宜一半,稳定性没差

MD专用机,双路CPU应该配2块GPU,只装1块GPU是浪费CPU。
如果没有2块GPU的预算,用单路平台就行了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-9 15:34:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-7 03:57
仔细看下文了解基本相关常识,并且参考里面的GPU加速推荐配置
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com ...

我们现在换成了一块索泰的3070

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-9 15:33:36 | 只看该作者 Only view this author
Entropy.S.I 发表于 2022-1-7 00:49
跑gmx的话,内存应该多几个通道,理想状态是2x6通道插满,根据预算决定,反正一根肯定不行。
预算充足,应 ...

那就是在现有的基础上加至12根内存条和两块3070的显卡,这有点我们的预算了。10根内存条可以加,但是这个显卡就有点难,这个两块GPU和一块GPU的计算速度差距很大嘛,我们的体系一般在10万以内,100ns以内。

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发表于 Post on 2022-1-7 03:57:33 | 只看该作者 Only view this author
仔细看下文了解基本相关常识,并且参考里面的GPU加速推荐配置
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

1080不仅性能弱,而且只能买到二手的

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-1-7 00:49:02 | 只看该作者 Only view this author
跑gmx的话,内存应该多几个通道,理想状态是2x6通道插满,根据预算决定,反正一根肯定不行。
预算充足,应该充分利用2个CPU的能力,再加一块同型号GPU。
实际跑MD时不能用2颗CPU带1块GPU,速度还不如1颗CPU(PCIe通道对应正确的前提下)。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-6 20:12:06 | 只看该作者 Only view this author
sylar 发表于 2022-1-6 20:08
GPU上30系列吧,能快不少

那就换成3070

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发表于 Post on 2022-1-6 20:08:30 | 只看该作者 Only view this author
GPU上30系列吧,能快不少

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