求助，密度相关函数计算

ONTHEWAY · 发表于 Post on 2022-2-19 22:03:52

我在一篇文献中看到密度相关函数的计算，请问大家知道这是怎么计算的吗？是Gromacs可以直接计算，还是有其他软件可以计算吗？还是需要自己编程？谢谢do:10.1021/acs.jpcb.1c10000

ONTHEWAY · 发表于 Post on 2022-2-20 11:34:01

hdmd 发表于 2022-2-20 01:13
需要自己编程，公式的想表达的意思是，将体系分割为若干个盒子，对于第i个盒子，如果周围盒子密度上升（下 ...

好的谢谢您

hdmd · 发表于 Post on 2022-2-20 01:13:43

需要自己编程，公式的想表达的意思是，将体系分割为若干个盒子，对于第i个盒子，如果周围盒子密度上升（下降），i盒子密度也上升（下降），则Di×Dj值为1，否则为-1，以此来判断相关性。但是好像没给出怎么定义的相邻，到底是周围26个盒子，还是相邻的6个，还是其他的什么，没说的很明白，但是看结果应该是周围27个吧

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[GROMACS] 求助，密度相关函数计算