请问如何将计算得到的RESP电荷分配到构建的聚合物上

高处裹棉被 · 发表于 Post on 2022-3-14 20:16:46

本帖最后由高处裹棉被于 2022-3-14 20:16 编辑

各位老师好，我使用Avogadro建立cml文件后，采用PolyParGen脚本后在OPLS-AA力场下创建了3个重复单元的PET聚合物，并选择了默认的mulliken电荷，得到了PET的itp文件

然后我使用了sob老师给的高斯懒人脚本在gas环境下计算3个重复单元PET的RESP电荷，并得到chg文件，现在我想用UltraEdit将其charge复制黏贴过去，但请问我该怎么一一对应上？
谢谢各位老师了

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-15 14:25:36

确保3个重复单元的寡聚物模型里头部、中部、尾部的原子顺序和你实际聚合物里三类单元的原子顺序一样。末端单元的电荷直接用ultraedit列模式复制过去，中间的自己写个脚本，重复N输出N次，N是中间的重复单元数，然后挪过去就完了

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