求助MS中如何确定或修改单个原子的价态

yun · 发表于 Post on 2022-3-18 13:12:42

请问在这个Fe-N4结构中，如何通过MS确定Fe是+2还是+3价，如果想要比较两种不同价态掺杂的区别，有什么办法修改Fe的价态？

Eudaimonia · 发表于 Post on 2024-3-24 16:31:13

WXKMS 发表于 2024-3-23 13:46
想请教一下给体系加电荷应该如何操作呢，用的是MS中的castep与doml模块

setup 界面有一个charge，这个应该是设置体系整体电荷的参数

好久没用MS了，建议早点换程序

WXKMS · 发表于 Post on 2024-3-23 13:46:34

Eudaimonia 发表于 2022-3-18 14:16
一般来说是通过计算确定电荷分布
MS里提供了设置formal charge的功能，但具体对计算有何影响不确定
另外 ...

想请教一下给体系加电荷应该如何操作呢，用的是MS中的castep与doml模块

yun · 发表于 Post on 2022-3-28 10:03:53

本帖最后由 yun 于 2022-3-28 10:06 编辑

Elucidating the Mechanistic Origin of a Spin State-Dependent.pdf (5.76 MB, 下载次数 Times of downloads: 51) 可以帮忙看下这篇文章中是怎么区分Fe的两种价态的吗，文章好像没有写出来

yun · 发表于 Post on 2022-3-18 20:55:19

Eudaimonia 发表于 2022-3-18 14:16
一般来说是通过计算确定电荷分布
MS里提供了设置formal charge的功能，但具体对计算有何影响不确定
另外 ...

感谢回复~
我不设置formal charge直接优化完后，Fe上显示的formal charge是2，改成3之后电荷量也没有变化
设置整个体系的背景电荷为+2与+3，得到的Fe上的电荷差为0.08，好像区别也不大

看的很多文献也是通过改变结构来算的，如果要改变结构的话，在这个基础上怎么改呢？

ML-catalyze · 发表于 Post on 2022-3-18 16:54:56

Eudaimonia 发表于 2022-3-18 16:40
个人认为这样比认为赋予价态更合理一些

好的，感谢老师回复

Eudaimonia · 发表于 Post on 2022-3-18 16:40:03

ML-catalyze 发表于 2022-3-18 15:42
请问是不是改变周围配位环境就相当于改变Fe的价态了

个人认为这样比认为赋予价态更合理一些

ML-catalyze · 发表于 Post on 2022-3-18 15:42:11

Eudaimonia 发表于 2022-3-18 14:16
一般来说是通过计算确定电荷分布
MS里提供了设置formal charge的功能，但具体对计算有何影响不确定
另外 ...

请问是不是改变周围配位环境就相当于改变Fe的价态了

Eudaimonia · 发表于 Post on 2022-3-18 14:16:35

一般来说是通过计算确定电荷分布
MS里提供了设置formal charge的功能，但具体对计算有何影响不确定
另外一种可能可以调节价态的方式是给整个体系增加一个电荷，这种情况下电荷具体会被加到什么位置是不确定的

从个人认识角度来说，电子结构决定一切，在你原子结构不变化的情况下Fe突然从+2 变为+3是一个很奇怪的事情，类似激发态的感觉，并不确定能否实际存在

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