计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3464|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 双金属协同催化过渡态计算总报错

[复制链接 Copy URL]

34

帖子

0

威望

167

eV
积分
201

Level 3 能力者

计算过渡态时,在计算hessian矩阵时就出现了如图的错误,然后就报错了。atom number 在180-260之间,会有一定概率出现这个情况,160以下没有遇到过。
计算水平如图,已经尝试的方法有:
1.不知道是不是def的自带赝势的问题,所以用gencep试了下ccpvdz,不太行,还是会有问题。
2.换用低水平,b3lyp/6-31g(d)/sdd,只有一个跑动了,1/6,换到def2svp guess=read 继续跑,目前正常。
3.虽然也没说convergence有问题但是我还是对scf动了心思,在思想家公社看了解决scf不收敛的文章然后试了试 scf=(novaracc,noincfock) int=acc2e=12 来搞,1/5的成功率,感觉关系不是很大..个人感觉是calcfc的时候的问题
所有截至目前6个要算的任务只跑起来了两个..


另,由于双金属协同催化过渡态位阻比较大,我尝试过从产物出发进行优化然后拉长C-C键去opt=ts,但是我发现,上述方法没有搞定的分子,在产物优化的最后一步计算频率时也会报错!就是出现很多NaN导致out文件都无法直接用GW打开,而是要用记事本打开从第一个NaN直接删到结尾的内种..

求老师们解答!初学者,对这个错误产生的原理完全不懂,难道是G09的bug要换用G16??





202204251033272390..png (7.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 35)

202204251033272390..png

202204251030015131..png (20.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

202204251030015131..png

34

帖子

0

威望

167

eV
积分
201

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-26 14:14:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-4-26 08:02
可能是优化算法的bug,没有具体输出文件没法更进一步说

盲猜回答,可以尝试opt里加上cartesian,或者用r ...

昨天尝试了换用不同坐标系!cartesian可以解决一部分问题!多谢老师

34

帖子

0

威望

167

eV
积分
201

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-26 14:13:30 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2022-4-25 16:16
你这优化到最后可能是结构无法改变了 试着改变初始构型  通过旋转 间距等

调整过了呜呜呜,卡在这儿1周了

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2022-4-26 08:02:51 | 只看该作者 Only view this author
可能是优化算法的bug,没有具体输出文件没法更进一步说

盲猜回答,可以尝试opt里加上cartesian,或者用recalc等等试试
实在不行也可以尝试用ORCA优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

739

帖子

0

威望

1715

eV
积分
2454

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2022-4-25 16:16:18 | 只看该作者 Only view this author
你这优化到最后可能是结构无法改变了 试着改变初始构型  通过旋转 间距等

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 20:41 , Processed in 0.182005 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list