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[GROMACS] 求助 acpype.py产生离子液体拓扑文件报错

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老师,我在使用acpype.py产生咪唑型离子液体阳离子拓扑文件出现如图报错,请问是什么原因呢?离子液体阳离子在PM7级别下粗优化的,对应文件为IL.mol2


IL.mol2

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-27 00:11:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-26 04:20
用Sobtop产生轻轻松松:
http://sobereva.com/soft/Sobtop
参考里面“产生苯甲酸甲酯的GROMACS的拓扑和gr ...

好的,谢谢Sob老师,我学习一下

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发表于 Post on 2022-5-26 04:20:05 | 只看该作者 Only view this author
用Sobtop产生轻轻松松:
http://sobereva.com/soft/Sobtop
参考里面“产生苯甲酸甲酯的GROMACS的拓扑和gro文件:参数完全基于GAFF的” 例子

acpype已经没什么用处了

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