Materials Studio中Amorphous有机物溶液建模问题

Tifo · 发表于 Post on 2022-6-2 12:17:48

在使用Materials Studio中Amorphous选项建立有机物分子链与水分子形成的溶液盒子的时候，生成的模型中有机物分子链总是会超过盒子边界一部分，虽然是周期性边界，但是想问一下各位老师有没有什么方法可以让分子链不出去啊

zt2327697647 · 发表于 Post on 2023-7-28 09:44:05

我觉得可以用packmol尝试一下，把有机分子固定在盒子中间，我也是新手，不确定，或者你应该也可以在MS中直接移动有机分子吧？

wjx2022 · 发表于 Post on 2023-5-17 22:41:01

Tifo 发表于 2022-6-4 10:33
额我的意思是能否让有机物分子在盒子的中间区域不是显示的问题

请问您解决了吗？我也不想让分子超出盒子

Tifo · 发表于 Post on 2022-6-4 10:33:01

Sunburst丶yu 发表于 2022-6-2 15:12
这个只是显示问题，可以右键display style，在lattice中选择in-cell

额我的意思是能否让有机物分子在盒子的中间区域不是显示的问题

Sunburst丶yu · 发表于 Post on 2022-6-2 15:12:44

这个只是显示问题，可以右键display style，在lattice中选择in-cell

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