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[Amber] AmberTools18安装过程问题求解

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请教一下 安装 ambertool过程中,
在amber18目录下运行./configure --skip-python gnu
这一步出现这个问题(如图所示)
请问这个问题怎么解决呢?


202207241500582389..png (119.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

202207241500582389..png

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发表于 Post on 2022-7-25 01:53:52 | 只看该作者 Only view this author
可能文件包没拷全,或者解压问题,或者自动更新时把文件搞乱了之类
AmberTools 18文件包的AmberTools\src目录里直接就有截图里提示的configuration2文件。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2022-7-26 02:29:08 | 只看该作者 Only view this author
用尺子量海 发表于 2022-7-25 17:39
第二次安装时候的截图

把flex装上
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-27 00:25:00 | 只看该作者 Only view this author
flex转上了 ,这个问题解决了
在最后一部的时候
make install的时候
出现很多警告


输入anterchamber
显示的结果也是 command not found。。。
请问这是怎么回事呢?

202207270023333702..png (198.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

202207270023333702..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-27 00:27:41 | 只看该作者 Only view this author
安装完成了了 非常感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-27 00:25:23 | 只看该作者 Only view this author
这是输入anterchamber的结果

202207270025068742..png (195.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-25 17:39:21 | 只看该作者 Only view this author
第二次安装时候的截图

1233345466.png (160.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-25 17:38:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-25 01:53
可能文件包没拷全,或者解压问题,或者自动更新时把文件搞乱了之类
AmberTools 18文件包的AmberTools\src ...

我又重新安装了一下  这次报错问题不一样 ?
但是总体还是有一个问题
两次都是升级到update.14的时候报错:
NOTE:update_amber only updates the raw source code! You must recompile if you want to changes to take effect!
这个是因为软件包里面的原材料 raw source出了问题嘛?





第二次运行的时候
Error: Unable to run flex; this is required for NAB and antechamber.
       Please check your PATH, or install the program.
请问一下这个错误又怎么解决呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-25 16:46:12 | 只看该作者 Only view this author
明白了 感谢社长 我在继续去研究研究

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