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[xtb] xtb是否可以用来优化分子的化学吸附成键过程?

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楼主
尊敬的各位老师和专家:
xtb程序所使用的计算方法是Geometry, Frequency, Noncovalent, eXtended TB(GFN-xTB)。GFN-xTB属于一种新的、特殊用途的半经验紧束缚方法,用于计算具有1000或更多原子的大分子系统的结构、振动频率和非共价相互作用。(S. Grimme, C. Bannwarth, P. Shushkov. A robust and accurate tight-binding quantum chemical method for structures, vibrational frequencies, and noncovalent interactions of large molecular systems parametrized for all spd-Block elements (Z = 1–86) J. Chem. Theory Comput., 13 (5) (2017) 1989-2009)那这么来看的话,GFN-xTB只能考虑非共价相互作用,那么化学吸附成键这种共价作用xtb是无法计算的。可是,GFN-xTB还使用了紧束缚方法,紧束缚是可以考虑到电子计算的,而且xtb计算也会进行SCC迭代。
所以总感觉很矛盾,有些不理解,还请尊敬的各位老师和专家可以指导一下,非常感谢!





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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-2 23:12:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-1 11:42
GFN-xTB是量子化学级别的方法,可以描述成键断键
目前xtb程序里只有GFN-FF没法用来研究涉及成键断键的问题 ...

感谢sobereva老师的指导和批评,我以为名字里面的GFN的N对应Noncovalent,以为就是完全代表非共价了。我对方法理解太片面了,望文生义了,我接下来一定仔细认真阅读一下原文和相关综述进行学习。再一次感谢sobereva老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-2 23:01:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-9-30 22:31
xtb只是对于非共价相互作用能算得比较准而已,对于共价作用可以算,但是相对而言不准。文章只说了这种方法 ...

非常感谢您的回答,谢谢!

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发表于 Post on 2022-10-1 11:42:27 | 只看该作者 Only view this author
GFN-xTB是量子化学级别的方法,可以描述成键断键
目前xtb程序里只有GFN-FF没法用来研究涉及成键断键的问题,因为这是力场,而且还是非反应力场
了解一个方法别光看某个地方几句只言片语的描述(更何况你贴的文字也没否认能描述成键断键、化学反应相关问题)。起码把原文或者相关综述看了,多了解点相关东西。
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发表于 Post on 2022-9-30 22:31:16 | 只看该作者 Only view this author
xtb只是对于非共价相互作用能算得比较准而已,对于共价作用可以算,但是相对而言不准。文章只说了这种方法可以用来算结构、振动频率和非共价相互作用,也就是说这三个方面是xtb的主要用途,并没有说其他方面一概不能算。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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