求助：在跑molecular dynamics时，出现l402报错，不知道是什么原因，求指导

哇卡卡卡卡卡

我现在正在显性溶剂下跑molecular dynamics，首先对初始过渡态进行采样，在运行的时候，出现了402错误，在“Gaussian 常见报错及解决方法；新手求助报错时的注意事项”中没有找到相应的l402错误，具体的错误如下：
Solvent              : Dichloromethane, Eps=   8.930000 Eps(inf)=   2.028346
------------------------------------------------------------------------------
UFF calculation of energy and first derivatives.
------------------------------------------------------------------------------
Atomic radii for non-electrostatic terms: SMD-CDS.
------------------------------------------------------------------------------
Out-of-memory error in routine PCMMM2 (IEnd=   12794095258 MxCore=    2414961310)
Use %mem=12203MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.
Error termination via Lnk1e in /public/software/apps/g16/g16/l402.exe at Sun Oct  2 20:19:57 2022.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes 48.7 seconds.
Elapsed time:       0 days  0 hours  0 minutes  2.9 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    124 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
#############################################
exiting function firstpoint.
Sun Oct  2 20:19:59 CST 2022
Error termination in firstreturn = 1

我试过了不是相应的内存错误，脚本中设置的核数和内存为processors 18、memory 36GB
不知道接下来该怎么处理了，请大佬们指教！

sobereva

哇卡卡卡卡卡 发表于 2022-10-3 09:34
谢谢sobereva老师，我把smd关键词删了以后，出现了这种错误 ：End of file in ZSymb.我发现下面的原子个 ...

输入文件末尾必须有两个空行，命令行下运行Gaussian的基本常识

哇卡卡卡卡卡

sobereva 发表于 2022-10-3 06:26
UFF（以及任何分子力场）都没法和SMD以及各种基于PCM的溶剂模型结合使用

谢谢sobereva老师，我把smd关键词删了以后，出现了这种错误 ：End of file in ZSymb.我发现下面的原子个数变少了，在progdyn程序中的gentail脚本是有空格的，不知道为什么会出现End of file in ZSymb这种错误
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1 for low   level calculation on real  system.
Charge =  0 Multiplicity = 1 for high  level calculation on model system.
Charge =  0 Multiplicity = 1 for low   level calculation on model system.
C                    -1.50702   0.95218  -1.78289
H                    -0.97308   0.94881  -2.72593
C                    -2.7265    0.11932  -1.51482
C                    -1.46514   1.95911  -0.83921
C                    -2.3318    1.62864   0.21883
C                    -2.92146   0.39078  -0.04184
H                    -0.78245   2.799    -0.83703
H                    -2.42482   2.18551   1.14292
H                    -3.76108  -0.00369   0.52063
C                    -0.38056  -0.71915  -0.39808
C                    -1.39516  -0.92451   0.52265
H                    -2.65716  -0.93096  -1.79792
H                    -3.57057   0.56576  -2.06117
H                    -2.02456  -1.80421   0.4426
H                    -0.26768  -1.35225  -1.27161
C                     0.71101   0.19089  -0.03462
O                     0.65616   0.87609   0.97473
C                     1.88667   0.30892  -0.98438
H                     1.65213   1.05641  -1.75051
H                     2.1007   -0.6346   -1.49149
H                     2.76543   0.64729  -0.43429
H                    -1.24065  -0.53648   1.52197
O                    -14.50034   0.33561   8.47698  M
H                    -14.53772  -0.54448   8.94045  M
H                    -14.8092   0.13407   7.55498  M
O                    -12.07644  -0.49087   10.52527  M
H                    -12.32984   0.46766   10.58143  M
H                    -11.46635  -0.62067   11.30367  M
O                    -3.51947   1.09158   12.91469  M
H                    -2.79922   0.93575   12.20569  M
H                    -4.17838   1.66666   12.44274  M
O                    -1.02359   0.75553   5.97537  M
H                    -1.7986    0.14057   5.94709  M
H                    -1.41609   1.65404   5.82546  M
O                     0.12286   1.89463   12.43575  M
H                    -0.15373   1.02356   12.81906  M
H                    -0.22305   1.87875   11.50712  M
O                    -10.22646  -0.6187    13.91887  M
H                    -10.51138  -1.41184   14.48021  M
H                    -10.2419   0.13931   14.56797  M
O                    -2.19303   6.70008   11.81055  M
H                    -2.30549   5.90586   11.22774  M
H                    -1.40573   6.47918   12.37396  M
O                    -10.29584   1.36345   8.68584  M
H                    -11.18473   1.75516   8.45354  M
H                    -9.93612   1.9696    9.39637  M
O                    -3.81143   2.12843   7.42906  M
H                    -4.19087   1.93368   6.52782  M
H                    -3.21021   2.9034    7.28355  M
O                    -2.42394   3.94312   13.82895  M
H                    -3.34106   4.17318   13.48559  M
H                    -1.87116   3.81069   12.99784  M
O                    -6.51017   2.42609   10.64369  M
H                    -7.18152   1.85579   10.18998  M
H                    -5.89081   2.70218   9.91107  M
O                    -13.24558  -3.60839   10.4727  M
H                    -12.52944  -3.37188   9.81915  M
H                    -12.8569  -4.34683   11.02826  M
O                    -6.47256  -0.04381   13.59651  M
H                    -6.4652    0.23323   12.64137  M
H                    -7.45251   0.37619   13.91932  M
O                    -5.43484   5.61868   11.34117  M
H                    -5.79217   5.33363   10.45731  M
H                    -5.19211   4.77186   11.79975  M
O                    -1.52635  -7.97644   12.54427  M
H                    -1.78179  -7.48023   11.69169  M
H                    -1.5452   -7.25013   13.24155  M
O                    -8.46762   5.08328   5.42281  M
H                    -8.77169   4.24232   4.86006  M
H                    -8.67813   5.79628   4.68356  M
O                    -12.83596   1.94422   13.77335  M
H                    -12.48893   1.22357   13.08376  M
H                    -11.97135   2.30438   14.12041  M
O                    -10.19263  -3.83429   8.1014   M
H                    -10.02757  -3.79427   7.09519  M
H                    -9.86627  -2.92836   8.44164  M
O                    -12.21501  -3.47894   4.90579  M
H                    -12.42199  -3.81096   5.82793  M
H                    -12.77702  -2.66211   4.81008  M
O                    -15.22397   1.75604   11.33669  M
H                    -14.27155   2.20699   11.30499  M
H                    -14.92143   0.79472   11.52818  M
O                    -8.56217  -0.59677   10.76641  M
H                    -9.12893  -1.02173   10.06796  M
H                    -8.45265  -1.31571   11.45637  M
O                    -7.86218  -2.95972   14.38188  M
H                    -7.88109  -2.58733   13.43295  M
H                    -6.75023  -2.96669   14.52926  M
O                    -6.26035   3.29384   14.35226  M
H                    -6.5032    2.99791   13.39093  M
H                    -5.50675   2.68697   14.57874  M
O                    -12.41016  -6.34793   7.40487  M
H                    -11.5749  -6.16558   6.82715  M
H                    -12.33402  -5.7445    8.31691  M
O                    -3.48     -2.79431   9.09284  M
H                    -4.3918   -3.01304   9.42968  M
H                    -3.00185  -2.40343   9.90859  M
O                    -3.5311   -1.09245   15.33379  M
H                    -4.25469  -1.72228   15.08208  M
End of file in ZSymb.
Error termination via Lnk1e in /public/software/apps/g16/g16/l101.exe at Mon Oct  3 09:24:18 2022.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  7.4 seconds.
Elapsed time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.4 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      6 Int=      0 D2E=      0 Chk=    145 Scr=      1
#############################################
exiting function secondpoint.
Mon Oct  3 09:24:18 CST 2022
Error termination in secondreturn = 2

sobereva

UFF（以及任何分子力场）都没法和SMD以及各种基于PCM的溶剂模型结合使用