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[GROMACS] 关于plumed metad block analysis

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楼主
老师们好,我使用plumed 的metad做2D well-tempered,对于一个平衡了的体系跑了800ns,现在想用block analysis分析收敛性,我follow的是官网的这个教程
https://www.plumed.org/doc-master/user-doc/html/trieste-4.html

但是我绘制出来的block error曲线并不是先上升后水平,一开始size=1的时候,error就有2kj/mol,在后面也有2kj左右(可以看err.block),想问下为什么会出现这种情况?

我的想法是:
1)轨迹问题:轨迹我是每1ns记录一次,所以最后drive得到的reweight文件只有800个数据,根本做不到像官网到1000个block size;想问下大家是否我要调整写入轨迹次数;
2)参数问题:do_block_fes.py需要几个参数,比如上下限格点这样,这些参数怎么取才合理呢?我有时候会得到一些空点(error=inf)

十分感谢大家的解答

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