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[GROMACS] 小分子的原子无法被CGenFF识别

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楼主
请问大家一个问题,我在用CGenFF生成一个含有S原子的小分子的str文件时,因含有一个S原子不能生成这个文件,然后我用ATB生成的ITP文件里面有一个CPos不能被识别,我下面该如何修改呀。我的ITP文件上传已上传,出错如下:ERROR 1 [file SAM.itp, line 7]: Atomtype CPos not found
There was 1 note
------------------------------------------------------
Program:     gmx grompp, version 2020.1-Ubuntu-2020.1-1
Source file: src/gromacs/gmxpreprocess/toppush.cpp (line 1408)
Fatal error:
There was 1 error in input file(s)



SAM.itp

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发表于 Post on 2022-11-1 17:15:29 | 只看该作者 Only view this author
用sobtop产生拓扑文件,什么困难都不会有
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