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最近使用vmd编写脚本时发现这样的一个问题,统计时出现这样的情况,前面统计出现未完全统计就意外结束,只有最后一次循环完全统计结束。请看图,脚本我贴在后面,请大家帮我看看,具体也是根据网上的脚本自己改了一下,加了循环。- #---------------------------------------------------
- proc lbond {sel fp1 step} {
- set select1 [atomselect top "$sel"]
- set inde [$select1 get index]
- #---------------------------------------------------
- foreach k $inde {
- set sel1 [atomselect top "index [expr $k-1]"]
- set sel2 [atomselect top "index $k"]
- if {[expr $k % 2] == 0} {
- set outfile [open lbond/[expr $k-1]-$k.dat w]
- set nf [molinfo top get numframes]
- for { set i $fp1 } { $i <= 4700 } { incr i $step} {
- $sel1 frame $i
- set ct1 [measure center "$sel1"]
- $sel2 frame $i
- set ct2 [measure center "$sel2"]
- set vsub [vecsub $ct1 $ct2]
- set vlen [veclength $vsub]
- if {$vlen < 4} {
- puts $outfile "$i $vlen"
- } else {puts $outfile "$i 0"}
- }
- }
- puts "done!"
- }
- close $outfile
- puts "All Done!"
- }
复制代码
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