MS-Reaction preview失败

zhengwula

请问各位大佬，我在用MS的Castep做反应物与产物的GeomOpt后发现两者固定原子的坐标变化较大，导致在尝试搜索过渡态时弹出error：Fixed atom coordinates should match to within 0.0010.检查Calc文件并没有勾选Optmize cell和dipole correction，请问这个应该怎么解决呢？非常感谢！

zhengwula

WilliamH 发表于 2022-12-23 13:24
计算一下反应物和产物被固定原子坐标之间的差值（是一个向量），然后以反应物的原子坐标为基准把产物的原子 ...

非常感谢！是我在opt产物的时候没有注意fix它的分数坐标，现在已经可以计算TS的pathway了

WilliamH

计算一下反应物和产物被固定原子坐标之间的差值（是一个向量），然后以反应物的原子坐标为基准把产物的原子坐标整体移动前面计算的向量（反过来移动也可以），这样应该就不会报错了。PS：其实在建模的时候就应该考虑到这个问题，产物直接从反应物复制过去，然后再微调原子坐标。