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[综合交流] dushin计算出错

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用dushin计算一个金属铱(Ir)配合物时出现如下错误

UNMAPPED #2 atom            2           6
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请问应该怎么解决?
附件是相关分子式和所有的输入文件
万分感谢!


result.zip

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发表于 Post on 2018-4-28 12:19:34 | 只看该作者 Only view this author
18843147053 发表于 2016-6-7 08:44
不好意思呀sob老师,您可能记错了,我还没在群里问过这个问题呐~
不过问题解决啦,真的很谢谢你们的帮助 ...

您好,请问你的问题是如何解决的,我的问题是出现一堆0kb的文件,然后输出文件是空白的,我应该怎么调整呢

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发表于 Post on 2016-12-29 21:07:39 | 只看该作者 Only view this author
yjmaxpayne 发表于 2016-6-6 15:10
把Dushin输入文件第一行改一下,不知道你的是怎么写的。通常出现这种问题的时候把常用的2 2改成2 0就好,  ...

感谢!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-7 16:05:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-7 09:21
问这个的不是你么?

难怪会以为是我~跟我遇到的问题和想法好像呀~
但是这个不是我,之所以这么肯定是因为我在群里潜水至今一句话都没说过。。。

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发表于 Post on 2016-6-7 09:21:31 | 只看该作者 Only view this author
18843147053 发表于 2016-6-7 08:44
不好意思呀sob老师,您可能记错了,我还没在群里问过这个问题呐~
不过问题解决啦,真的很谢谢你们的帮助 ...

问这个的不是你么?

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-7 08:44:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-7 08:38
之前就在群里跟你说过改第一行第二个参数你说还是不行

不好意思呀sob老师,您可能记错了,我还没在群里问过这个问题呐~
不过问题解决啦,真的很谢谢你们的帮助~

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发表于 Post on 2016-6-7 08:38:56 | 只看该作者 Only view this author
18843147053 发表于 2016-6-7 07:21
真是太谢谢您啦!用这个方法就解决问题啦!好开心~
谢谢您!


之前就在群里跟你说过改第一行第二个参数你说还是不行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-7 07:21:45 | 只看该作者 Only view this author
yjmaxpayne 发表于 2016-6-6 15:10
把Dushin输入文件第一行改一下,不知道你的是怎么写的。通常出现这种问题的时候把常用的2 2改成2 0就好,  ...

真是太谢谢您啦!用这个方法就解决问题啦!好开心~
谢谢您!

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发表于 Post on 2016-6-6 15:10:19 | 只看该作者 Only view this author
把Dushin输入文件第一行改一下,不知道你的是怎么写的。通常出现这种问题的时候把常用的2 2改成2 0就好, 以基态分子原子顺序为准而不让程序去自动决定。 另外优化T1的时候建议读入S0的check,可以避免一些麻烦。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-6 14:42:55 | 只看该作者 Only view this author
五十八 发表于 2016-6-6 14:39
Jeffrey Reimers  写了一个一样的dushin,不知道一不一样,这是他的邮箱可以问下

谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-6 14:42:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-6 08:05
发邮件问作者,谁写的程序谁最清楚

谢谢!

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发表于 Post on 2016-6-6 08:05:02 | 只看该作者 Only view this author
18843147053 发表于 2016-6-6 07:27
按照您说的方法我又优化了S0和T1态,加上nosymm
但是依然和之前的错误一样
是不是分子的S0和T1态结构相 ...


发邮件问作者,谁写的程序谁最清楚
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-6 07:27:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-5 00:43
你先优化S0,然后基于其结构再优化T1
两个优化都带着nosymm关键词,免得高斯大幅度调整期朝向,然后再试。

按照您说的方法我又优化了S0和T1态,加上nosymm
但是依然和之前的错误一样
是不是分子的S0和T1态结构相差太大dushin就无法计算?
或者能不能从源程序上做一些数值改变(程序我不太懂,读起来很费劲)
请问sob老师还有没有其他的解决方案
谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-5 16:21:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 18843147053 于 2016-6-5 22:18 编辑

@sobereva
按照您说的方法我又优化了S0和T1态,加上nosymm
但是依然和之前的错误一样
是不是分子的S0和T1态结构相差太大dushin就无法计算?
或者能不能从源程序上做一些数值改变(程序我不太懂,读起来很费劲)
请问sob老师还有没有其他的解决方案
谢谢您!

freq-S0.zip

4.24 MB, 下载次数 Times of downloads: 14

freq-T1.zip

8.1 MB, 下载次数 Times of downloads: 7

结构优化log文件.zip

7.46 MB, 下载次数 Times of downloads: 13

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楼主
发表于 Post on 2016-6-5 00:43:36 | 只看该作者 Only view this author
你先优化S0,然后基于其结构再优化T1
两个优化都带着nosymm关键词,免得高斯大幅度调整期朝向,然后再试。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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