求助，关于处理蛋白质-配体复合物pdb文件

qingqingdong · 发表于 Post on 2023-2-14 16:02:58

各位老师，我最近在做关于蛋白质-配体复合物的MD，现在在预处理中，图1是pdb文件中非蛋白质成分，BTN是我需要的，NAG要去掉（图2中圈起来的），现在问题是：我在pdb文件中把NAG删掉后（图3），就变成了图2中第二个图，少了一条链（这里为什么会少了一条链呢）；
如果把蛋白质去掉，只留BTN和NAG，则变成图2中第三个图；

我想问一下这是为什么，那条链为什么会消失

qingqingdong · 发表于 Post on 2023-2-15 12:07:44

sobereva 发表于 2023-2-15 06:02
把CONECT 15 617 及之后的内容也删掉即可

明白，非常感谢

sobereva · 发表于 Post on 2023-2-15 06:02:27

把CONECT 15 617 及之后的内容也删掉即可

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[综合交流] 求助，关于处理蛋白质-配体复合物pdb文件