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[其它程序] 求助:gmx_MMPBSA运行报错

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     各位老师和前辈,请教一下下面的问题:在ubuntu 18.04安装gmx_MMPBSA  v1.5.7 (https://github.com/Valdes-Tresanco-MS/gmx_MMPBSA)后, 运行examples里的文件(examples/Protein_glyca)报错(IndexError: string index out of range),运行命令为:gmx_MMPBSA -O -i mmpbsa.in -cs com.tpr -ci index.ndx -cg 1 26 -ct com_traj.xtc -o FINAL_RESULTS_MMPBSA.dat -eo FINAL_RESULTS_MMPBSA.csv,麻烦指教一下,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-20 20:47:39 | 只看该作者 Only view this author
ecolitib 发表于 2023-2-20 15:56
谢谢告知。抱歉回答错了。

没事没事,谢谢您热心的回复!

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发表于 Post on 2023-2-20 15:56:50 | 只看该作者 Only view this author
charmm36 发表于 2023-2-18 16:25
问了作者,找到原因了,是因为安装的是ParmEd4.0,换了ParmEd 3.4版本就没问题了

谢谢告知。抱歉回答错了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-18 16:25:01 | 只看该作者 Only view this author
ecolitib 发表于 2023-2-15 16:15
好像是需要指定topol文件。

问了作者,找到原因了,是因为安装的是ParmEd4.0,换了ParmEd 3.4版本就没问题了

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发表于 Post on 2023-2-15 16:15:12 | 只看该作者 Only view this author
好像是需要指定topol文件。

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