Gromacs蒸发焓计算求助

446584935 · 发表于 Post on 2023-2-22 21:04:06

本帖最后由 446584935 于 2023-2-22 21:20 编辑

参照卢老师课上的讲义计算蒸发焓，对公式的具体的数值还不太明确，还麻烦各位老师解答。我想计算链烃的蒸发焓，请问：
1.气相下的模拟就是一个盒子里吗只放一个链烃吗？
2.液相下是同样大小的盒子里面放多个链烃吗?
3.每摩尔分子的平均势能就是仿真过后用gmx energy里面potential的选项吗？
4. RT代表什么含义呢？

446584935 · 发表于 Post on 2023-2-23 09:24:27

sobereva 发表于 2023-2-23 04:26
1 是

2 是。具体来说，你先算凝聚相的烷烃，之后用同等尺寸的盒子去模拟单个烷烃

明白了！感谢卢老师！

sobereva · 发表于 Post on 2023-2-23 04:26:26

1 是

2 是。具体来说，你先算凝聚相的烷烃，之后用同等尺寸的盒子去模拟单个烷烃

3 那叫模拟，不叫仿真
是，但必须带着-nmol [体系里分子数]。课上说了

4 理想气体近似下PV=nRT。当前n=1

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