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[GROMACS] 如何在分子模拟中实现 “reflecting particle membrane”效果?

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读到一篇文献介绍了一种 “reflecting particle membrane” (RPM)方法,其主要功能是在分子模拟中设置一个虚拟的膜,沿指定方向到达该膜平面的分子可以自由通过,逆着指定方向到达该膜的分子有概率会被反弹。示意图如下:



文献链接:https://journals.aps.org/pre/pdf/10.1103/PhysRevE.57.7259

该方法可用于在纳米流体中模拟一个压力梯度(Nano Lett. 2008, 8, 9, 2788–2793):


如果要在GMX或LAMMPS中实现上述RPM效果,请问大家有没有好的思路或者替代的方法?



心之所向,日复一日,必有精进

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