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[GROMACS] 计算比热容时的-nmol设置求助

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各位老师,这个图中的nmol后写的是分子数不太理解。在水摩尔分数为0.5的离子液体水溶液中计算比热容,分子个数(200个离子对+200水分子),这个分子数填多少啊。

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发表于 Post on 2023-3-8 22:33:57 | 只看该作者 Only view this author
qiyan 发表于 2023-3-5 20:57
谢谢大佬的回复。模拟电导率的误差也有点大,有什么方法可以优化吗?

有些体系的有些量本来就难以模拟准,可能本来目前就没有理想的计算模型
先搜离子液体水溶液相关文章看类似体系目前都能模拟到什么准确度
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-5 20:57:53 | 只看该作者 Only view this author
Jotaro 发表于 2023-3-4 08:42
试试使用OPC或OPC3水模型,社长之前在某帖子发过

谢谢大佬的回复。模拟电导率的误差也有点大,有什么方法可以优化吗?

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发表于 Post on 2023-3-4 08:42:21 | 只看该作者 Only view this author
qiyan 发表于 2023-3-3 21:36
非常感谢谢sob老师的回答。、
离子液体选择的是GAFF,水分子是SPCE,密度误差小于3%,粘度误差小于20%。 ...

试试使用OPC或OPC3水模型,社长之前在某帖子发过

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-3 21:36:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-2 07:05
那是对于纯物质而言的
诸如你的体系有1000个水,直接给你的是每摩尔这种盒子的热力学量,加了-nmol 1000给 ...

非常感谢谢sob老师的回答。、
离子液体选择的是GAFF,水分子是SPCE,密度误差小于3%,粘度误差小于20%。不设置分子数,计算出的比热容误差与实验值差一个数量级,有什么方法进行优化嘛。

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发表于 Post on 2023-3-2 07:05:46 | 只看该作者 Only view this author
那是对于纯物质而言的
诸如你的体系有1000个水,直接给你的是每摩尔这种盒子的热力学量,加了-nmol 1000给你的就是结果除以1000,即每摩尔水分子的热力学量。你这种情况不需要设
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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