求助在linux系统下装Materials Studio8.0提交不了任务怎么办

lixixi · 发表于 Post on 2023-3-12 20:17:22

本帖最后由 lixixi 于 2023-3-12 20:23 编辑

大家好，我就是想请问下我在linux系统下安装好了MS8.0的版本，但是我提交任务提交不了，在xshell下输入命令一提交就掉任务，也不知道问题出现在哪里。提交命令为：nohup /home/sam/Accelrys/MaterialsStudio8.0/etc/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 8 文件名 > out &
（命令路径就是安装路径）

ldx022 · 发表于 Post on 2023-8-18 19:41:53

孤忆梦影发表于 2023-3-20 09:59
MaterialsStudio8.0/etc/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 4 12mof-test 记得没错的话是这样提交你可以试试

大佬你好输入文件在这里的附件，脚本文件不知道为什么考不上来，我发您私信里了，感谢！

孤忆梦影 · 发表于 Post on 2023-3-20 09:59:10

MaterialsStudio8.0/etc/DMol3/bin/RunDMol3.sh -np 4 12mof-test 记得没错的话是这样提交你可以试试

lixixi · 发表于 Post on 2023-3-17 10:54:52

孤忆梦影发表于 2023-3-14 09:15
先试一下单核运算可以不可以的话就是并行的问题 mpi没装好或者没有加载环境变量

单核计算也不行

孤忆梦影 · 发表于 Post on 2023-3-14 09:15:00

先试一下单核运算可以不可以的话就是并行的问题 mpi没装好或者没有加载环境变量

lixixi · 发表于 Post on 2023-3-13 21:29:48

孤忆梦影发表于 2023-3-13 09:35
命令是对的文件不对在MS界面下搭建相关模型，并在calculation对话框中进行相关设置完成设置后，请按下cal ...

嗯嗯我是六个文件都在然后还是提交不上我查看了DMol3.log文件，报错如下，不知道这是什么意思

lixixi · 发表于 Post on 2023-3-13 21:22:17

Eudaimonia 发表于 2023-3-12 21:35
没用过，但是我猜

/home/sam/Accelrys/MaterialsStudio8.0/etc/DMol3/bin/*.sh -np 8 12mof-test.inp > ...

没有用欸

孤忆梦影 · 发表于 Post on 2023-3-13 09:35:26

本帖最后由孤忆梦影于 2023-3-13 09:38 编辑

命令是对的文件不对在MS界面下搭建相关模型，并在calculation对话框中进行相关设置完成设置后，请按下calculation对话框下方的file按钮，选择save files files里面应该是有六个文件的六个文件都要在同一文件夹目录 windows下会隐藏

Eudaimonia · 发表于 Post on 2023-3-12 21:35:49

没用过，但是我猜

/home/sam/Accelrys/MaterialsStudio8.0/etc/DMol3/bin/*.sh -np 8 12mof-test.inp > out

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