g16优化甜菜碱离子，生成的结构很奇怪

陈小黑啊啊啊 · 发表于 Post on 2023-3-13 10:39:35

请问使用b3lyp/6-311g的优化方法进行优化，生成的几何结构如图所示

sobereva · 发表于 Post on 2023-3-13 21:14:09

别用6-311G这种搞笑的基组，好好看此文再做计算
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336（http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html）

ChrisZheng · 发表于 Post on 2023-3-13 12:31:39

PBE0/def2-TZVP优化的

Novice · 发表于 Post on 2023-3-13 11:59:27

应该是你初始结构给的极度不合理，如果不懂得合理结构怎么构建，这种已知分子可以网上搜一下相关数据库，就能给你比较好的初始结构。
我搜了下PubChem，里面有此分子晶体结构对应的信息（https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/247）

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