运行gmx_MMPBSA时出现大量debug: false是报错吗？

nanlio · 发表于 Post on 2023-4-26 12:55:10

本帖最后由 nanlio 于 2023-4-26 12:57 编辑

请问大家，我用了gmx_MMPBSA库中的example例子，按照官网提示运行了下述命令后，

(gmxMMPBSA) [root@GROMACS ST]# gmx_MMPBSA -O -i mmpbsa.in -cs com.tpr -ct com_traj.xtc -ci index.ndx -cg 3 4 -cp topol.top -o FINAL_RESULTS_MMPBSA.dat -eo FINAL_RESULTS_MMPBSA.csv

出现了很长的信息，最终能够显示gmx_MMPBSA_ana工具并分析数据。

但出现这么长的信息不知是否有报错？例如出现很多"debug": false, 以及QXcbConnection: XCB error: 145 (Unknown) 这些信息。

输出文件在附件中

nanlio · 发表于 Post on 2023-4-26 14:07:24

解决了。

查了一下
"debug: false" 是一个配置文件中的选项之一，通常用于调试或记录详细的调试信息。这个选项的值为 false 表示不启用调试模式，也就是不记录详细的调试信息。

通常情况下，"debug: false" 的出现不会对系统的正常运行产生任何影响。这个选项只是为了方便开发人员进行调试和错误诊断而添加的，如果您不是开发人员并且不需要进行系统调试，则可以忽略这个选项。

XCB error，参考https://www.cnblogs.com/Bella2017/p/10960758.html

在Mobaxterm中关闭X11的RANDER勾去掉，就不出现这个报错了

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[GROMACS] 运行gmx_MMPBSA时出现大量debug: false是报错吗？