AOCC编译VASP后运行命令问题

chever · 发表于 Post on 2023-5-10 17:27:36

本帖最后由 chever 于 2023-5-10 17:29 编辑

抄Sob的作业买的7R32工作站参考VASP | AMD和在AMD机器上安装DFT计算软件VASP.6.2.0简明教程 - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社 (keinsci.com)通过AOCC成功编译VASP

但官方文档中的提交命令有点看不懂
mpirun -np 32 -x OMP_NUM_THREADS=4 --map-by ppr:2:l3cache:pe=4 --bind-to core -x UCX_TLS=self,sm,rc_x $vasp

我尝试改动了一下，但速度都很慢。烦请各路大大帮忙看看

糖炒DFT · 发表于 Post on 2025-1-8 16:37:16

xwaaa 发表于 2024-9-1 11:39
请问怎么绑定插槽？

mpirun --bind-to socket --map-by socket -np $SLURM_NTASKS vasp_std

xwaaa · 发表于 Post on 2024-9-1 11:39:52

糖炒DFT 发表于 2024-5-22 22:42
可以试试绑定插槽提交，我绑定核心跑就巨慢，换成绑定插槽就比较快，无论MPI还是MPI+openMP；机器 7763 ...

请问怎么绑定插槽？

糖炒DFT · 发表于 Post on 2024-5-22 22:42:16

ggshining 发表于 2024-1-23 19:29
我用AOCC+AOCL编的vasp6.3.2，纯MPI的版本始终比MPI+openMP的版本快一点，带openMP的版本只要用多线程速度 ...

可以试试绑定插槽提交，我绑定核心跑就巨慢，换成绑定插槽就比较快，无论MPI还是MPI+openMP；机器 7763 ；

ggshining · 发表于 Post on 2024-1-23 19:29:58

我用AOCC+AOCL编的vasp6.3.2，纯MPI的版本始终比MPI+openMP的版本快一点，带openMP的版本只要用多线程速度就降，用单线程和纯MPI版本差不多，略慢一点点。
也是不知道为什么，CPU是双路AMD9654

nicejunjie · 发表于 Post on 2023-7-15 02:10:35

amd的fortran compiler是用的基于open source pgfortran的f18项目。目前不是很建议使用非intel和非pgi/nvidia的fortran 编译器。

chever · 发表于 Post on 2023-5-11 19:25:19

hebrewsnabla 发表于 2023-5-11 18:22
双路7R32只有96核，你一楼的写法用了128线程，三楼的写法用了32*48个线程，当然慢了……

是有修改的，4*8, 4*16, 8*4, 8*8, 16*4都有试过

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2023-5-11 18:22:22

双路7R32只有96核，你一楼的写法用了128线程，三楼的写法用了32*48个线程，当然慢了……

chever · 发表于 Post on 2023-5-11 16:20:32

biogon 发表于 2023-5-11 14:16
我看了下那个帖子，用spack编出来的可能就是不太行，不用那个方法编译，改makefile用aocc+aocl编很快可以 ...

十分感谢，迫不及待要试试啦

biogon · 发表于 Post on 2023-5-11 14:16:36

本帖最后由 biogon 于 2023-5-11 14:51 编辑

chever 发表于 2023-5-11 12:14
现在用aocc编译出来的就是比mkl的慢，可能没编译好或者运行有问题吧，哈哈

我看了下那个帖子，用spack编出来的可能就是不太行，不用那个方法编译，改makefile用aocc+aocl编很快可以参考我最新发的帖子

chever · 发表于 Post on 2023-5-11 12:14:06

abin 发表于 2023-5-11 10:55
鄙人仅仅在笔记本上测试过,
应该是AMD 6800H, ThinkBook笔记本.
同样是8核心, 计算速度, 和Intel ...

现在用aocc编译出来的就是比mkl的慢，可能没编译好或者运行有问题吧，哈哈

abin · 发表于 Post on 2023-5-11 10:55:01

chever 发表于 2023-5-11 09:30
感谢，我试了一下啦，应该是调用了很多线程，还是很慢

鄙人仅仅在笔记本上测试过,
应该是AMD 6800H, ThinkBook笔记本.
同样是8核心, 计算速度, 和Intel处理器不相上下.

chever · 发表于 Post on 2023-5-11 09:30:24

FUcreature 发表于 2023-5-10 18:19
不如返朴归真，直接看看效果如何

感谢，我试了一下啦，应该是调用了很多线程，还是很慢

FUcreature · 发表于 Post on 2023-5-10 18:19:11

不如返朴归真，直接

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看看效果如何

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[并行运算] AOCC编译VASP后运行命令问题