求助，单个离子通过管道的自由能

吹梦到西洲

打算利用SMD来做离子通过环状聚合物的孔的自由能，类似于gromacs tutorials里面伞形抽样的那个案例。
第一是怎么确保离子能通过孔（有点不明白是怎么确定拉伸方向的 沿Y轴，正轴还是负轴呢？），第二是在产生pull.tpr的文件的时候，在mdrun的时候报错如图1，我尝试改了盒子大小，改了拉伸的距离都报错，就是像这样差一点。