计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1205|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合讨论] phonopy算的自由能数值在低温下为何为正值?

[复制链接 Copy URL]

6

帖子

0

威望

29

eV
积分
35

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
最近用phonopy的功能phonopy -t mesh.conf -c  POSCAR-unitcell得到了结构的自由能,但是发现在低温下结构的自由能为正值。但是同样的结构vasp得到的数值就为负值(F= -.10197374E+04)
看了phonopy计算自由能的公式,感觉它算的就是体系在这个温度下的自由能。但为何跟vasp算的数值有天壤之别。。。。难道是phonopy算的是从0K 到该温度下的δF? 但如果是这样的话,在0K下的δF应该为0才对。。。不太明白,请各位大神指教

以下为phonopy算的在不同温度下的自由能数值

# temperature[K] Free energy [kJ/mol] Entropy [J/K/mol] Heat capacity [J/K/mol] Energy [kJ/mol]
     0.0000000     94.8141587      0.0000000      0.0000000     94.8141587
    10.0000000     94.8122692      0.5627799      1.1467641     94.8178970
    20.0000000     94.7982387      2.5422929      5.8551495     94.8490846
    30.0000000     94.7546386      6.5386615     15.2604912     94.9507984
    40.0000000     94.6602217     12.6954164     28.7410774     95.1680384
    50.0000000     94.4942787     20.7799454     44.5207855     95.5332760
    60.0000000     94.2397112     30.3379275     60.7898696     96.0599869
    70.0000000     93.8841871     40.8995820     76.5092822     96.7471578
    80.0000000     93.4196197     52.0953194     91.3628405     97.5872453
    90.0000000     92.8410122     63.6747533    105.4170257     98.5717400
   100.0000000     92.1453741     75.4813520    118.8469473     99.6935093
   110.0000000     91.3309503     87.4195104    131.7997326    100.9470964
   120.0000000     90.3967492     99.4286435    144.3552368    102.3281864
   130.0000000     89.3422822    111.4666601    156.5335082    103.8329480
   140.0000000     88.1674295    123.5007959    168.3165139    105.4575409
   150.0000000     86.8723726    135.5031361    179.6688688    107.1978430
   160.0000000     85.4575561    147.4487463    190.5526178    109.0493555
   170.0000000     83.9236621    159.3150810    200.9358885    111.0072259
   180.0000000     82.2715864    171.0819145    210.7968582    113.0663310
   190.0000000     80.5024152    182.7314186    220.1246778    115.2213847
   200.0000000     78.6174007    194.2482178    228.9186716    117.4670443
   210.0000000     76.6179366    205.6193700    237.1867264    119.7980043
   220.0000000     74.5055344    216.8342698    244.9434319    122.2090738
   230.0000000     72.2818004    227.8844901    252.2082883    124.6952331
   240.0000000     69.9484152    238.7635863    259.0041307    127.2516759
   250.0000000     67.5071148    249.4668812    265.3558262    129.8738351
   260.0000000     64.9596741    259.9912461    271.2892413    132.5573981
   270.0000000     62.3078924    270.3348897    276.8304557    135.2983126
   280.0000000     59.5535810    280.4971595    282.0051824    138.0927857
   290.0000000     56.6985529    290.4783621    286.8383583    140.9372779
   300.0000000     53.7446137    300.2796013    291.3538676    143.8284941
   310.0000000     50.6935549    309.9026358    295.5743690    146.7633720
   320.0000000     47.5471474    319.3497561    299.5211998    149.7390694
   330.0000000     44.3071372    328.6236769    303.2143384    152.7529506
   340.0000000     40.9752411    337.7274460    306.6724066    155.8025727
   350.0000000     37.5531444    346.6643671    309.9127017    158.8856729
   360.0000000     34.0424983    355.4379337    312.9512474    162.0001544
   370.0000000     30.4449182    364.0517748    315.8028570    165.1440749
   380.0000000     26.7619828    372.5096087    318.4812043    168.3156341
   390.0000000     22.9952335    380.8152053    320.9988965    171.5131636
   400.0000000     19.1461736    388.9723546    323.3675487    174.7351154
   410.0000000     15.2162686    396.9848412    325.5978568    177.9800535
   420.0000000     11.2069464    404.8564235    327.6996673    181.2466443
   430.0000000      7.1195974    412.5908171    329.6820447    184.5336488
   440.0000000      2.9555752    420.1916814    331.5533340    187.8399150
   450.0000000     -1.2838031    427.6626088    333.3212196    191.1643709
   460.0000000     -5.5972556    435.0071173    334.9927800    194.5060184
   470.0000000     -9.9835355    442.2286440    336.5745384    197.8639272
   480.0000000    -14.4414298    449.3305409    338.0725094    201.2372298
   490.0000000    -18.9697585    456.3160716    339.4922415    204.6251166
   500.0000000    -23.5673739    463.1884098    340.8388565    208.0268310
   510.0000000    -28.2331596    469.9506382    342.1170854    211.4416659
   520.0000000    -32.9660296    476.6057480    343.3313014    214.8689594
   530.0000000    -37.7649272    483.1566400    344.4855496    218.3080920
   540.0000000    -42.6288244    489.6061248    345.5835745    221.7584830
   550.0000000    -47.5567208    495.9569244    346.6288448    225.2195876
   560.0000000    -52.5476427    502.2116741    347.6245765    228.6908948
   570.0000000    -57.6006426    508.3729239    348.5737533    232.1719240

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112439

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2023-10-15 16:03:24 | 只看该作者 Only view this author
calvincui 发表于 2023-10-15 10:38
也就是把这一列换算成eV然后加到VASP算出的能量上就是这个温度下的自由能数值是吗?

我不用VASP,对单位不清楚
把单位弄统一,加上去就是
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

6

帖子

0

威望

29

eV
积分
35

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-15 10:38:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-18 00:08
Phonopy给你的是自由能热校正量,加到电子能量上才是自由能

也就是把这一列换算成eV然后加到VASP算出的能量上就是这个温度下的自由能数值是吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112439

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-5-18 00:08:21 | 只看该作者 Only view this author
Phonopy给你的是自由能热校正量,加到电子能量上才是自由能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 23:15 , Processed in 0.164382 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list