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[Multiwfn使用咨询] 如何用multiwfn改变图片的坐标

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老师好,我这里有一个multiwfn生成的波函数等值面图,想修改坐标,不知道怎么操作,希望有人指导一下,谢谢


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XZ.PNG

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-27 16:25:25 | 只看该作者 Only view this author
The absolute value of bond order >=  0.050000                                
#    1:    1(Fe)    4(N ) Alpha:   0.138719 Beta:  0.131824 Total:  0.270543
#    2:    1(Fe)    5(C ) Alpha:  -0.026259 Beta: -0.028155 Total: -0.054414
#    3:    1(Fe)    8(C ) Alpha:  -0.026300 Beta: -0.028199 Total: -0.054499
#    4:    1(Fe)    9(N ) Alpha:   0.138766 Beta:  0.131808 Total:  0.270574

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-27 16:22:24 | 只看该作者 Only view this author
老师,我在做键级分析的时候,因为是开壳层体系,出来的键级数据分成α和β轨道的,还有最后Total, 我就想问一下,分析的时候是用α那组数据呢,还是Total那组数据?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-26 22:16:16 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢老师回复我问的这么低级的问题,再次感谢!

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发表于 Post on 2016-7-26 21:42:32 | 只看该作者 Only view this author
Eliza-NZH 发表于 2016-7-26 15:04
老师,我知道原子间成键态比反键态能量低。结构更稳定,我现在就是想用NBO方法结合Multiwfn分析出原子间是 ...


最土的做法:用Multiwfn算个Mulliken键级,看符号是正负就完了。正是成键,负是反键。先载入.fch文件,然后输入9,再输入4。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-26 15:04:50 | 只看该作者 Only view this author
老师,我知道原子间成键态比反键态能量低。结构更稳定,我现在就是想用NBO方法结合Multiwfn分析出原子间是成键态还是反键态, 时间比较紧急,因为要急着写好文章投出去,您能不能简单的和我说一下计算过程,您只需要大体说一下过程就行,不用说太多,因为我现在刚学习这个,您说得多了我会糊涂的,非常感谢!

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发表于 Post on 2016-7-22 23:59:45 | 只看该作者 Only view this author
Eliza-NZH 发表于 2016-7-22 14:50
我这个是结合实验给一点分子轨道分析,不需要太深刻,就想说一点简单点的,我刚学这个高斯计算,不敢分析太 ...

根本不是这么看的。说法太粗糙的。
你先看结构化学书了解什么是成键和反键轨道,是什么轨道形状。
这和原子之间密度大小都完全八竿子打不着。
原子之间密度大小要考虑所有轨道,而且密度大小跟成键强弱根本没直接关系。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-22 14:50:06 | 只看该作者 Only view this author
我这个是结合实验给一点分子轨道分析,不需要太深刻,就想说一点简单点的,我刚学这个高斯计算,不敢分析太深奥的东西,回头审稿人再问我比较难得问题我回答不出就不好了,不是说两原子之间如果电子密度大那就是成键态,反之就是反键态吗?这个图是分子波函数轨道等值线图,我从中可以看出电子分布的大小啊,难道不可以简单判断出成键和反键态吗

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发表于 Post on 2016-7-22 13:33:53 | 只看该作者 Only view this author
Eliza-NZH 发表于 2016-7-22 12:40
谁知道上面的轨道等值线图的分析主要抓住哪几点?在写文章,能分析出是成键态还是反键态吗?跪求大神指导

一言难尽
主要看成键区域有没有节面来判断
或者可以用Multiwfn做Mulliken键级分解,看看对指定的两个原子,各个轨道对Mulliken键级是正贡献还是负贡献
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-22 12:40:53 | 只看该作者 Only view this author
谁知道上面的轨道等值线图的分析主要抓住哪几点?在写文章,能分析出是成键态还是反键态吗?跪求大神指导

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-22 12:24:43 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师

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发表于 Post on 2016-7-21 19:25:01 | 只看该作者 Only view this author
Eliza-NZH 发表于 2016-7-21 15:15
老师,我想让我的图片纵横坐标轴一样长,保存出来的图片就是个正方形,这就是我的目的,因为我有三张图片, ...


你得选择6:Input origin and translation vector (For expert user),自定义平移矢量,使得对三个体系,在两个方向上平移矢量大小相同。或者用5:Define by three points,对三个体系使用相同的三个点来定义作图平面。
要么就导出平面数据,用sigmaplot之类对三个体系作图,然后调节坐标轴使其一致。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-21 15:15:05 | 只看该作者 Only view this author
老师,我想让我的图片纵横坐标轴一样长,保存出来的图片就是个正方形,这就是我的目的,因为我有三张图片,排版的时候想将三个一行排开,可是有的是长方形,不好看,所以我想三个都是正方形就好了

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发表于 Post on 2016-7-21 11:53:31 | 只看该作者 Only view this author
你想怎么改坐标?
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