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[其它程序] 关于COLVARS中upperBoundary和lowerBoundary理解问题

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楼主
各位老师好,我在使用lammps+colvars程序和伞形采样的方法计算一分子的气液分配时,偶然间遇到一个问题,我误把upperBoundary设置成centers,分析得到的结果,发现histogram1.dat和colvars.traj中的数据不一致,histogram1.dat中的数据严格在upperBoundary和lowerBoundary限定范围内,但是colvars.traj文件中存在超过upperBoundary和lowerBoundary限定范围的数据,我去看了这篇帖子http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 5&fromuid=30893里面提到upperBoundary和lowerBoundary是定义记录上下界的意思。我可不可以这样理解:
1.colvars.traj中的数据记录的是分子在伞形采样中真实存在的状态,而histogram1.dat是根据upperBoundary和lowerBoundary限定的范围来记录想要看到的分子存在状态?
2.设置的upperBoundary和lowerBoundary不会影响伞形采样中分子的存在状态?这样就不会影响伞形采样的结果?
感谢各位老师花时间看我这篇帖子,底子比较薄弱,希望各位老师不吝赐教。

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