求助使用Gaussian对γ-环糊精和镁离子进行结构优化时为什么环糊精上的氢原子会断开

JCWJK · 发表于 Post on 2023-6-19 15:38:22

各位大佬请教一下用Gaussian计算镁离子与gamma环糊精的包结行为时，对其进行结构优化和热频计算结束后为什么γ-环糊精上的一个氢原子断开了？应该怎么补救？

JCWJK · 发表于 Post on 2023-6-20 23:41:25

好的谢谢大佬

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-19 20:38:54

先把这个看了
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

某些情况下，氢键作用较强，使得原本氢与重原子之间的距离较远，哪怕只是超过阈值一丁点，也会判断不出键，甭管它

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[新手求助] 求助使用Gaussian对γ-环糊精和镁离子进行结构优化时为什么环糊精上的氢原子会断开