水球中SO4-2发生显著团聚是否合理

五月雨 · 发表于 Post on 2023-6-20 20:28:44

本帖最后由五月雨于 2023-6-20 21:42 编辑

各位老师好，我在常温常压下通过分子动力学过程产生小型硫酸液滴时发现，水球中阴阳离子发生了显著聚集，是否合理？硫酸根在水里面不应该是分布均匀的吗？

水使用的是OPC3、SO42-以及H3O+的参数是基于GAFF力场下的产生的，电荷使用的是RESP。

下面是在水溶液中的分布，请老师们看一看是否有问题，需不需要换力场参数：

chenzhe · 发表于 Post on 2023-6-22 09:25:55

五月雨发表于 2023-6-21 10:38
嗯，多谢老师提醒。我在后面会考虑到这一点，硫酸浓度也会调低

硫酸浓度调低也没用，gaff、opls这两个对高价阴离子和阳离子的结合能力严重高估了（就算很稀的浓度，阴阳离子也能成团）。得用专门的力场，你可以查查相关论文，有修正参数。不过我不记得了，之前我查过。

五月雨 · 发表于 Post on 2023-6-21 10:38:55

GoldenBaby 发表于 2023-6-21 04:54
我想补充一点，就是你有没有考虑你这个溶液的硫酸浓度。正常来说，如果浓度比较高的话，硫酸氢根离子可能会 ...

嗯，多谢老师提醒。我在后面会考虑到这一点，硫酸浓度也会调低

GoldenBaby · 发表于 Post on 2023-6-21 04:54:08

我想补充一点，就是你有没有考虑你这个溶液的硫酸浓度。正常来说，如果浓度比较高的话，硫酸氢根离子可能会更多的存在。建议你还是要充分考虑硫酸二级解离不完全的问题，这样可能会让你的模拟结果会更好一点。

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-20 23:51:50

五月雨发表于 2023-6-20 21:44
sob老师，我添加了溶液中模拟的结果，您再看一下

没什么必然问题

五月雨 · 发表于 Post on 2023-6-20 21:44:32

sobereva 发表于 2023-6-20 20:32
可以先跑浸在水盒子里的情况看是什么现象
当前硫酸根浓度已经非常高了，静电吸引作用结合在一起并不奇怪， ...

sob老师，我添加了溶液中模拟的结果，您再看一下

五月雨 · 发表于 Post on 2023-6-20 20:34:48

sobereva 发表于 2023-6-20 20:32
可以先跑浸在水盒子里的情况看是什么现象
当前硫酸根浓度已经非常高了，静电吸引作用结合在一起并不奇怪， ...

好的老师

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-20 20:32:15

可以先跑浸在水盒子里的情况看是什么现象
当前硫酸根浓度已经非常高了，静电吸引作用结合在一起并不奇怪，特别是本来在液滴里的运动就高度受限

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] 水球中SO4-2发生显著团聚是否合理

评分 Rate