将小分子复制到表面时，表面原子缺失

安好 · 发表于 Post on 2023-7-11 15:28:59

本帖最后由安好于 2023-7-11 15:34 编辑

大佬们，我遇到的情况是这样的：
这是我已经优化后的表面：

接下来想研究一下分子在表面上的吸附，可是当分子复制到表面时，表面原子缺失，具体是这样的：

请问这种情况下，表面原子缺失会影响计算得到的分子的吸附能吗？应该怎样解决呢？

pal · 发表于 Post on 2023-7-11 15:42:09

这不叫表面原子缺失，是周期性盒子边上的原子没显示

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[CASTEP/Dmol3/MS] 将小分子复制到表面时，表面原子缺失