关于lammps如何实现远超周期性单元、无限长、自连接的聚合物分子链热分解的建模？

chuchutju

各位大佬好，本人用MS建立了包含一个C60F122聚合物分子链， 57个氧分子周期性单元的分子动力学模拟体系，随后使用lammps软件（reaxff 力场）模拟该体系在4000K下的热分解过程，旨在探索PTFE分子在高温氧环境下的反应历程。目前审稿人提出该体系的聚合物分子量（C60F122）太小，不能代表PTFE分子真实的反应过程，应当建立远超周期性条件、无限长、自连接的聚合物分子，并研究其降解过程，求助各位大佬如何在lammps中实现。审稿人意见原文如下：


As stated by the authors, the molecular weight of PTFE covered by the MD simulations is clearly too small for the experimental conditions. Additional data is needed to justify that the effect of molecular weight differences does not need to be carefully considered in this study. One solution seems to be to model an infinite length structure of self-connected PTFE chains beyond periodic boundary conditions and perform thermal decomposition simulations.


注：附件是本模拟的结构文件

sobereva

chuchutju 发表于 2023-7-17 19:27
意思是做不同分子量的模拟对吗，谢谢老师

是

chuchutju

slxc920113 发表于 2023-7-16 13:44
审稿人的意思是你应该比较不同的分子量的结果是否收敛，来说明你现在的模型可靠性

意思是做不同分子量的模拟对吗，谢谢老师

chuchutju

sobereva 发表于 2023-7-16 06:40
看清楚板块再发贴，求助学术贴不得发到“公社大厅”板块，公社大厅板块http://bbs.keinsci.com/forum-79-1. ...

谢谢管理员，我下次一定注意

slxc920113

审稿人的意思是你应该比较不同的分子量的结果是否收敛，来说明你现在的模型可靠性

sobereva

看清楚板块再发贴，求助学术贴不得发到“公社大厅”板块，公社大厅板块http://bbs.keinsci.com/forum-79-1.html版头超级巨大的红字提示得极其明确。这次给你移动了，下次如果普通学术求助帖再发到“公社大厅”板块，直接删帖+记违规+扣分处理。