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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › Gromacs模拟蛋白配体复合物体系做SMD时出现报错中断问题
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[GROMACS] Gromacs模拟蛋白配体复合物体系做SMD时出现报错中断问题

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m韩梅梅

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发表于 Post on 2023-7-27 15:56:15 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式 Reading model
在做模拟过程中，出现了报错说距离超过盒长的一半，按照提示，在mdp文件里的pull参数部分的“pull_geometry = direction”改为“pull-geometry = direction-periodic”之后，仍然会在同样的地方再次报错中断，报错内容一样，请问这种情况改如何解决？

202307271550268711..png (17.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

202307271550268711..png
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