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[新手求助] 用高斯计算路易斯酸开环过程过渡态遇到问题

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本帖最后由 ghkjhug 于 2023-8-2 16:48 编辑

最近在计算如图所示过渡态,遇到了个问题。我们推测的机理是三价铜做路易斯酸开三元环,但如果高斯只能设置整个体系电荷,要如何保证这一过程是三价铜氧化三元环,而非一价铜和被扣掉两个电子的三元环反应呢?
另外,因该过渡态有点难找,使用了柔性扫描和QST2,利用柔性扫描缩短碳铜键距离得到的能量最高点在2.1埃左右,但截出来找不到过渡态;用QST2未收敛,给出了一个不止一个虚频的结构,但最大的虚频振动方向基本对应,但碳铜键有3埃,请问是为何导致的这种差异

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-3 09:00:47 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-8-2 22:36
假如发生这种情况,可以认为反应大概率是先发生电子转移再反应的,电子转移速率用Marcus理论算。小概率是 ...

好的,谢谢

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发表于 Post on 2023-8-2 22:36:45 | 只看该作者 Only view this author
ghkjhug 发表于 2023-8-2 11:09
过渡态肯定按算出来的为准,但我担心假设这两个片段无限远,高斯在计算的时候是否会为了让体系能量最低, ...

假如发生这种情况,可以认为反应大概率是先发生电子转移再反应的,电子转移速率用Marcus理论算。小概率是反应前并没有发生电子转移,相当于反应体系一直在激发态势能面上反应,此时可以用TDDFT或MOM方法在激发态势能面上找过渡态。判断这个反应是不是在激发态势能面上走的,需要算激发态到基态的内转换速率常数
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-2 18:09:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-8-2 17:58
第一个问题,算出来是什么价态就是什么价态,在计算方法合理、波函数也找对了的情况下,如果算出来发现铜是 ...

过渡态肯定按算出来的为准,但我担心假设这两个片段无限远,高斯在计算的时候是否会为了让体系能量最低,从三元环挖俩电子给到无限远的三价铜上。如果有可能,是否会导致错误的结果?

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发表于 Post on 2023-8-2 17:58:17 | 只看该作者 Only view this author
第一个问题,算出来是什么价态就是什么价态,在计算方法合理、波函数也找对了的情况下,如果算出来发现铜是一价,那说明推测的机理推测错了。
第二个问题,确认一下扫描曲线是否平滑,如果在最高点附近不平滑,最高点未必接近过渡态
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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