求助：利用CP2K模拟H2O2与MOF反应

clh · 发表于 Post on 2023-8-7 21:12:14

本帖最后由 clh 于 2023-8-7 21:11 编辑

实验发现过氧化氢会使姜黄素-锌MOF崩解，想通过模拟证明。
本人属于没有化学直觉以及研究经验的那一类人

，想不出来具体的反应过程。是羟基自由基“抢了”姜黄素中酮基或是甲氧基与锌配位的位置吗？请问是先用CI-NEB找到过渡态吗？将羟基自由基以A点和B点为端点坐标摆放，结构优化能用xtb吗？我试了一下冻结外侧原子，保留三个锌原子在内周围大概六十个原子，用默认级别加上色散矫正要算好久。或者能冻结更多的原子？还是抠出来算团簇？又或者是没有过渡态，用别的方法算呢？

clh · 发表于 Post on 2023-8-8 17:24:34

slxc920113 发表于 2023-8-7 22:41
显然H2O2应该是把双键氧化打断了，典型的亲电过程，你只需要取一个片段研究就行，如果要考虑Zn的相互作用 ...

请问H2O2和双键亲电加成是一边生成醛基，一边生成羟基吗？但是我查到的只有两边生成羟基，双键变单键。

clh · 发表于 Post on 2023-8-8 08:49:21

好的，谢谢指点

。

slxc920113 · 发表于 Post on 2023-8-7 22:41:32

显然H2O2应该是把双键氧化打断了，典型的亲电过程，你只需要取一个片段研究就行，如果要考虑Zn的相互作用，那就加上一个配位的Zn2+。

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