关于使用CP2K进行MD运算异常终止的问题

jqian0402

我需要利用CP2K进行UiO-66的MD模拟，整个过程是在PBEsoul/DZVP-MOLOPT-SR-GTH，1.01325bar和300K下进行2000步的NPT-F模拟。输入文件uio66.cif uio66.inp在附件中。

目前我发现每次作业跑大概100步出头就会报MPI的错：

===================================================================================

=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES

=   PID 358775 RUNNING AT cb0906

=   EXIT CODE: 9

=   CLEANING UP REMAINING PROCESSES

=   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES

===================================================================================

   Intel(R) MPI Library troubleshooting guide:

      https://software.intel.com/node/561764

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输出文件（uio66.output）没有显示错误，SCF收敛过程中程序直接结束了。

前100步模拟过程中，压强波动很大，而且也没有收敛趋势（见下图 P-T-time.jpg），但我记得压强波动大也是正常现象。

想问一下这是我cp2k编译出现了问题么，还是哪里的设置有问题呢？

kkkil2

也遇到相同的情况。原先用的是intel mpi出错，改用open mpi就可以解决问题。

jqian0402

sobereva 发表于 2023-8-31 16:21
Step     Update method      Time    Convergence         Total energy    Change
  ---------------- ...

好的谢谢sob老师

sobereva

  Step     Update method      Time    Convergence         Total energy    Change
  ------------------------------------------------------------------------------
     1 Broy./Diag. 0.40E+00    5.9     0.00521310     -4335.3238336038 -4.34E+03
     2 Broy./Diag. 0.40E+00   15.7     0.00392658     -4335.3222975748  1.54E-03
     3 Broy./Diag. 0.40E+00  584.8     0.07794485     -4335.3218324554  4.65E-04
     4 Broy./Diag. 0.40E+00   23.8     0.07794267     -4334.7499788374  5.72E-01
     5 Broy./Diag. 0.40E+00   66.2     0.00016828     -4335.3279019497 -5.78E-01
     6 Broy./Diag. 0.40E+00  946.8     0.00012635     -4335.3309647850 -3.06E-03
     7 Broy./Diag. 0.40E+00   94.9     0.00005406     -4335.3309325929  3.22E-05
     8 Broy./Diag. 0.40E+00   95.6     0.00001335     -4335.3311282734 -1.96E-04
     9 Broy./Diag. 0.40E+00 1018.0     0.00000711     -4335.3309683340  1.60E-04
    10 Broy./Diag. 0.40E+00 1043.9     0.00001408     -4335.3306196232  3.49E-04
    11 Broy./Diag. 0.40E+00  194.4     0.00000539     -4335.3303535409  2.66E-04
    12 Broy./Diag. 0.40E+00  964.0     0.02738223     -4335.3300553716  2.98E-04
    13 Broy./Diag. 0.40E+00  101.7     0.03141761     -4334.5172016971  8.13E-01
    14 Broy./Diag. 0.40E+00  930.1     0.02286737     -4335.2233992569 -7.06E-01

到最后SCF耗时明显离谱
大概率编译有问题或者运行环境有问题
若无特殊情况，编译和运行都用OpenMPI