计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1392|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[分子对接] 使用Autodock能否设置金属配位的约束条件

[复制链接 Copy URL]

87

帖子

0

威望

728

eV
积分
815

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师同行们,我近日在用Autodock Vina进行金属酶-小分子对接的过程中,遇到了点问题,举个例子,我想要让小分子的羰基氧与金属配位,但是对接后总是N或者C与金属配位。想知道能否设置配位信息进行对接。我对接的过程是根据Autodock Vina官方教程进行操作的:https://autodock-vina.readthedocs.io/en/latest/docking_zinc.html
感谢各位了!





手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 07:39 , Processed in 0.160085 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list