计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1735|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molclus] 求助使用molclus都在0秒完成问题

[复制链接 Copy URL]

85

帖子

0

威望

1463

eV
积分
1548

Level 5 (御坂)

本帖最后由 liang666 于 2023-9-6 12:27 编辑

各位老师好,我在Linux上使用molclus,创建好traj.xyz文件后,启动molclus后都显示在0秒完成,请问这是哪块出问题了呢?

202309052118468754..png (36.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

202309052118468754..png

out.txt

11.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 7

settings.ini

3.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 13

template.gjf

145 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 12

template_SP.gjf

116 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4

template2.gjf

167 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

traj.xyz

54.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

gau00001.out

49.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

8

帖子

0

威望

107

eV
积分
115

Level 2 能力者

9#
发表于 Post on 2023-11-17 22:24:14 | 只看该作者 Only view this author
liang666 发表于 2023-9-8 09:20
好的,谢谢老师

请问解决了,我也是遇到这种情况

85

帖子

0

威望

1463

eV
积分
1548

Level 5 (御坂)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-8 09:20:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-8 01:23
Gaussian异常中断,属于运行环境的问题。先确保机子里的Gaussian能正常手动使用再说。另外,内存别给得那 ...

好的,谢谢老师

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125136

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2023-9-8 01:23:55 | 只看该作者 Only view this author
liang666 发表于 2023-9-6 12:28
老师您看我上传的gau00001.out文件,没提示错误在哪(其他out文件也都是这种情况),我不确定是不是SCF没收 ...

Gaussian异常中断,属于运行环境的问题。先确保机子里的Gaussian能正常手动使用再说。另外,内存别给得那么抠,注意看
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

153

帖子

2

威望

1536

eV
积分
1729

Level 5 (御坂)

计算化学公社外门弟子

6#
发表于 Post on 2023-9-6 14:55:45 | 只看该作者 Only view this author
liang666 发表于 2023-9-6 12:28
老师您看我上传的gau00001.out文件,没提示错误在哪(其他out文件也都是这种情况),我不确定是不是SCF没收 ...

建议你先拿 tarj.xyz 的其中一个结构单独用 g09 做 opt freq 试试是否会出现相同的问题。
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
School of Electronic Science and Engineering (National Model Microelectronics College)
Research interests: theoretical and computational chemistry and machine learning

85

帖子

0

威望

1463

eV
积分
1548

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-6 12:28:35 | 只看该作者 Only view this author
kimariyb 发表于 2023-9-6 11:52
提示已经很清楚了  The optimization failed due to certain reason, e.g. SCF unconvergence, three atoms ...

老师您看我上传的gau00001.out文件,没提示错误在哪(其他out文件也都是这种情况),我不确定是不是SCF没收敛的原因。还请老师仔细指点一下

153

帖子

2

威望

1536

eV
积分
1729

Level 5 (御坂)

计算化学公社外门弟子

4#
发表于 Post on 2023-9-6 11:52:04 | 只看该作者 Only view this author
提示已经很清楚了  The optimization failed due to certain reason, e.g. SCF unconvergence, three atoms are lying in the same line

Running: cp -f gau00001.out gau.out
Error: Optimization did not normally finish!
The optimization failed due to certain reason, e.g. SCF unconvergence, three atoms are lying in the same line
Error: Opt + freq task did not normally terminated!
The gau.out has been backed up to gau00001.out
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
School of Electronic Science and Engineering (National Model Microelectronics College)
Research interests: theoretical and computational chemistry and machine learning

85

帖子

0

威望

1463

eV
积分
1548

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-6 09:08:17 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2023-9-6 07:47
没有选 结构优化选项吧

你好,我在template.gjf文件里面加了opt的,但是还是不行

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2023-9-6 07:47:01 | 只看该作者 Only view this author
没有选 结构优化选项吧

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 10:54 , Processed in 0.180418 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list