腺嘌呤核苷酸优化过后磷酸基团远离原来的位置，还是腺嘌呤核苷酸吗？

hulei · 发表于 Post on 2023-9-7 10:03:42

优化完腺嘌呤核苷酸之后，发现最稳定的结构中磷酸基团分离了，成了磷酸。然后我给他加了Na+（这里想研究一下金属离子对腺嘌呤核苷酸的影响），但是，加了之后磷酸基团跑的更远，图在附件中。求大神解答一下这个是什么情况？

hulei · 发表于 Post on 2023-9-12 09:45:36

RAL 发表于 2023-9-12 09:40
那就是9楼的左图

好的，谢谢啦

RAL · 发表于 Post on 2023-9-12 09:40:05

hulei 发表于 2023-9-12 09:36
收到，我研究的是腺嘌呤核糖核苷酸，

那就是9楼的左图

hulei · 发表于 Post on 2023-9-12 09:36:11

RAL 发表于 2023-9-11 13:23
这不应该问你自己研究的是腺嘌呤脱氧核苷酸还是腺嘌呤核糖核苷酸吗

收到，我研究的是腺嘌呤核糖核苷酸，

RAL · 发表于 Post on 2023-9-11 13:23:29

hulei 发表于 2023-9-9 18:02
您好，我在网上仔细查阅了一下相关知识，它里面介绍到核苷酸有两种，结构如下图所示，是不是这两种都是腺 ...

这不应该问你自己研究的是腺嘌呤脱氧核苷酸还是腺嘌呤核糖核苷酸吗

hulei · 发表于 Post on 2023-9-9 18:02:14

RAL 发表于 2023-9-7 10:58
对的

您好，我在网上仔细查阅了一下相关知识，它里面介绍到核苷酸有两种，结构如下图所示，是不是这两种都是腺嘌呤核苷酸呢？

hulei · 发表于 Post on 2023-9-7 11:32:16

RAL 发表于 2023-9-7 10:58
对的

好的，谢谢啦

RAL · 发表于 Post on 2023-9-7 10:58:56

hulei 发表于 2023-9-7 10:45
最后再问一个问题，这张图是我刚查文献中看到的结构式，您看一下是这个样子的吗？

对的

hulei · 发表于 Post on 2023-9-7 10:45:08

hulei 发表于 2023-9-7 10:35
好的，感谢您的回答。谢谢

最后再问一个问题，这张图是我刚查文献中看到的结构式，您看一下是这个样子的吗？

hulei · 发表于 Post on 2023-9-7 10:35:12

RAL 发表于 2023-9-7 10:33
对着结构式手动搭建就好了

好的，感谢您的回答。谢谢

RAL · 发表于 Post on 2023-9-7 10:33:49

hulei 发表于 2023-9-7 10:25
感谢您的回复。那这个结构可以在RCSB库里下载吗还是有别的方法构建

对着结构式手动搭建就好了

hulei · 发表于 Post on 2023-9-7 10:25:40

RAL 发表于 2023-9-7 10:11
你应该仔细核对腺嘌呤核苷酸的结构。你建的模型中除了碱基其他结构都不对。

感谢您的回复。那这个结构可以在RCSB库里下载吗还是有别的方法构建

RAL · 发表于 Post on 2023-9-7 10:11:23

你应该仔细核对腺嘌呤核苷酸的结构。你建的模型中除了碱基其他结构都不对。

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[综合交流] 腺嘌呤核苷酸优化过后磷酸基团远离原来的位置，还是腺嘌呤核苷酸吗？