计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 579|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 关于Multiwfn加载cif文件报错的问题

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

540

eV
积分
548

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,我根据《使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域》(http://sobereva.com/617)尝试计算cif文件中的自由区域。当我将自己的THF@EtP4QA-OH.cif文件拖入到Multiwfn中后按下enter,窗口突然关闭,通过命令行得知报错如下:
Loading cell information
Loading information of unique atoms
Number of symmetrically unique atoms:    195
forrtl: severe (59): list-directed I/O syntax error, unit -5, file Internal List-Directed Read
Image              PC                Routine            Line        Source
Multiwfn.exe       00007FF6E84FC10D  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn.exe       00007FF6E84FB606  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn.exe       00007FF6E7EDA60C  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn.exe       00007FF6E7E92A97  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn.exe       00007FF6E815B150  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn.exe       00007FF6E8E6047B  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn.exe       00007FF6E9175CD0  Unknown               Unknown  Unknown
KERNEL32.DLL       00007FFF55527614  Unknown               Unknown  Unknown
ntdll.dll          00007FFF56C226B1  Unknown               Unknown  Unknown

随后我将参考blog中的C60.cif也拖入到Multiwfn中,并没有发生报错。完整的输出如下:
Loading cell information
Loading information of unique atoms
Number of symmetrically unique atoms:     10
Loading symmetry opteration and replicate atoms
Number of symmetry operations:  24
Totally     240 atoms

Loaded D:\Administrator\Desktop\C60.cif successfully!

Cell information
In Bohr:
Cell vector 1,  X=   26.53323  Y=    0.00000  Z=    0.00000  Norm:   26.53323
Cell vector 2,  X=    0.00000  Y=   26.53323  Z=    0.00000  Norm:   26.53323
Cell vector 3,  X=    0.00000  Y=    0.00000  Z=   26.53323  Norm:   26.53323
In Angstrom:
Cell vector 1,  X=   14.04078  Y=    0.00000  Z=    0.00000  Norm:   14.04078
Cell vector 2,  X=    0.00000  Y=   14.04078  Z=    0.00000  Norm:   14.04078
Cell vector 3,  X=    0.00000  Y=    0.00000  Z=   14.04078  Norm:   14.04078
Cell angles:  Alpha=  90.0000  Beta=  90.0000  Gamma=  90.0000 degree
Area between a and b:    197.1435 Angstrom^2
Area between b and c:    197.1435 Angstrom^2
Area between a and c:    197.1435 Angstrom^2
Cell volume:      18679.7175 Bohr^3    (       2768.0486 Angstrom^3 )
Density:   1.72924 g/cm^3    (  1729.244 kg/m^3 )
我想应该是Multiwfn在读取我的cif文件中某些参数时,因为某些问题导致读取不到,所以出现Multiwfn窗口突然关闭。但是通过对比两者cif文件内容,并不清楚是哪里存在问题。希望老师解答!


THF@EtP4QA-OH.cif

825.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

C60.cif

2.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112499

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2023-9-8 00:40:34 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn只支持所有原子占有度都为1的情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

43

帖子

0

威望

1011

eV
积分
1054

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2023-9-7 16:48:33 | 只看该作者 Only view this author
你这结构里面有无序,要删掉。因为会有原子距离过近的问题。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 14:40 , Processed in 1.862072 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list